RNA–Protein interactions for RNA: YMR025W

CSI1, Transcript of Subunit of the Cop9 signalosome, yeast

Gene CSI1, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI1	YMR025W	REC102	Q02721	264 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	OSW1	Q08692	278 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	ERR1	P0CX10	437 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	ERR2	P0CX11	437 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	PEX1	P24004	1043 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	GMH1	P36125	273 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	RIM13	Q03792	727 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	CDC9	P04819	755 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.36	□□□□□ -1.55	not detected
CSI1	YMR025W	GID8	P40208	455 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	MIH1	P23748	554 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	CAF16	P43569	289 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	COX18	P53239	316 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	SEC5	P89102	971 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	ECM3	Q99252	613 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	YGR151C	P53287	111 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	SEG1	Q04279	960 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CSI1	YMR025W	KCC4	P25389	1037 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	BCS1	P32839	456 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	YKR018C	P36114	725 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	YNL195C	P40168	261 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	PCL10	P53124	433 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	THI22	Q06490	572 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	MDM12	Q92328	271 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	STE12	P13574	688 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	HSL7	P38274	827 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	SPC98	P53540	846 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	ARP4	P80428	489 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	BIT2	P38346	545 aa		5.31	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	NHX1	Q04121	633 aa		5.31	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	5.31	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	ERG11	P10614	530 aa		5.3	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	ABF1	P14164	731 aa		5.3	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	YMC2	P38087	329 aa		5.3	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	YOR131C	Q12486	218 aa		5.3	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	PRP28	P23394	588 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	HOG1	P32485	435 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	MIT1	P40002	666 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	PIG2	P40187	538 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	FMP30	Q02883	468 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	YDL086W	Q07505	273 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	RAD18	P10862	487 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	GSY1	P23337	708 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	MEF1	P25039	761 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	VBA3	P25594	458 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	SEC6	P32844	805 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	TIM23	P32897	222 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	DSS1	P39112	969 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	GAT1	P43574	510 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
CSI1	YMR025W	PHO5	P00635	467 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	APN2	P38207	520 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	NNF1	P47149	201 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	NMA2	P53204	395 aa		5.27	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	CIT2	P08679	460 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	SRD1	P09007	221 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	PTP1	P25044	335 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	MPS3	P47069	682 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	LAM4	P38800	1345 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	NUP1	P20676	1076 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	YMC1	P32331	307 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	CTP1	P38152	299 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	LTP1	P40347	161 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	XBP1	P40489	647 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	RFX1	P48743	811 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	YOL098C	Q12496	1037 aa		5.24	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	MNN4	P36044	1178 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	NET1	P47035	1189 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.22	□□□□□ -1.57	not detected
CSI1	YMR025W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	KHA1	P40309	873 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	YIL077C	P40508	320 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	RPN4	Q03465	531 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	HFD1	Q04458	532 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
CSI1	YMR025W	RKI1	Q12189	258 aa		5.22	□□□□□ -1.57

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