RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	ASM4	Q05166	528 aa		5.3	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	GPR1	Q12361	961 aa		5.3	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	MLP2	P40457	1679 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	YLR415C	O13578	112 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	TDA3	P38758	523 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	RET2	P43621	546 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	YGR153W	P48238	217 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	ORC4	P54791	529 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	ENB1	Q08299	606 aa		5.29	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	UBP5	P39944	805 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	YBP2	P53169	641 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	TRM11	Q12463	433 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MTD1	YKR080W	CTF13	P35203	478 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	MNN4	P36044	1178 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	SIC1	P38634	284 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	RPP1	P38786	293 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.27	□□□□□ -1.57	not detected
MTD1	YKR080W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	PDR10	P51533	1564 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	TMA17	Q12513	150 aa		5.27	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	IRC24	P40580	263 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	ARP4	P80428	489 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	NRG1	Q03125	231 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	DCS2	Q12123	353 aa		5.26	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	TRM3	Q07527	1436 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	DCG1	P32460	244 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	YBR259W	P38338	688 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	PAF1	P38351	445 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	YJR039W	P47107	1121 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	IOC4	Q04213	475 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	LAS17	Q12446	633 aa		5.25	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	CTS1	P29029	562 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	TOM20	P35180	183 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	YKR075C	P36155	307 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	MAL31	P38156	614 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	BFA1	P47113	574 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	IQG1	Q12280	1495 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	DNF3	Q12674	1656 aa		5.24	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	MRC1	P25588	1096 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	EUG1	P32474	517 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	YJR120W	P47157	116 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	MRPS35	P53292	345 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	ERG5	P54781	538 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	ECM9	Q02202	377 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	TRE2	Q08693	809 aa		5.23	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	HCM1	P25364	564 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	DID4	P36108	232 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	APT2	P36973	181 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	APN2	P38207	520 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	ECM1	P39715	212 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	FKH2	P41813	862 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	FOL1	P53848	824 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	MCM21	Q06675	368 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	ESC8	Q08119	714 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	TGL5	Q12043	749 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MTD1	YKR080W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	YHR202W	P38887	602 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	PHO23	P50947	330 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	ARG5,6	Q01217	863 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	YHM2	Q04013	314 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	GAD1	Q04792	585 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	MET3	P08536	511 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	YBR071W	P38243	211 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	HXT7	P39004	570 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	BEM4	P39011	633 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	BUL1	P48524	976 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	DLT1	Q04216	342 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	AEP2	P22136	580 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	SEC65	P29478	273 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	OAF3	P36023	863 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	YHR112C	P38716	378 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MTD1	YKR080W	GID8	P40208	455 aa		5.19	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.6 ms