RNA–Protein interactions for RNA: YJR087W

YJR087W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJR087W, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR087W	YJR087W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.18	□□□□□ -1.74	not detected
YJR087W	YJR087W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	PEX1	P24004	1043 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	MNN4	P36044	1178 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	ARG2	P40360	574 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	NDC80	P40460	691 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	CTR1	P49573	406 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	ARP4	P80428	489 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	GUD1	Q07729	489 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	GLG1	P36143	616 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	MAL31	P38156	614 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	TDP1	P38319	544 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	YJL206C	P39529	758 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	MET13	P53128	600 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YJR087W	YJR087W	PHO11	P35842	467 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	YKR075C	P36155	307 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	PHO12	P38693	467 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	MNN1	P39106	762 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	GET2	P40056	285 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	BFA1	P47113	574 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	FHN1	P53279	174 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	ATG4	P53867	494 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	YPT53	P36019	220 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
YJR087W	YJR087W	MGS1	P40151	587 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	PIG2	P40187	538 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	YIL166C	P40445	542 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	TAH11	P47112	604 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	ABF1	P14164	731 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	PRP28	P23394	588 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	YHR202W	P38887	602 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	BDH2	P39713	417 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	DCS2	Q12123	353 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	TAF3	Q12297	353 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	ECM3	Q99252	613 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	SEC15	P22224	910 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	BIT2	P38346	545 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	VHS3	Q08438	674 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	MLH3	Q12083	715 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	BCS1	P32839	456 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	PPZ2	P33329	710 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	CKB2	P38930	258 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	YNL195C	P40168	261 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	ATF1	P40353	525 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	HLJ1	P48353	224 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	DNM1	P54861	757 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	THI22	Q06490	572 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	SUT2	Q12286	268 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	RPN13	O13563	156 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	PET127	P32606	800 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	TDA3	P38758	523 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	BEM4	P39011	633 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	RET2	P43621	546 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	YML122C	Q03207	126 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	USV1	Q12132	391 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	POM34	Q12445	299 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	ADR1	P07248	1323 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	SPO11	P23179	398 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	KIN82	P25341	720 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	GMH1	P36125	273 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJR087W	YJR087W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	KCC4	P25389	1037 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	FUB1	P25659	250 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	NTH1	P32356	751 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	SEC6	P32844	805 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJR087W	YJR087W	UBS1	P38290	277 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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