RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	CCIN	Q13939	588 aa		6.9	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC30A3	Q99726	388 aa		6.9	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		6.9	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		6.9	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		6.9	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
EFHC1-223	ENST00000636616	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		6.9	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		6.9	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		6.9	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		6.9	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	XYLB	O75191	536 aa		6.9	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	BMP4	P12644	408 aa		6.9	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	USP5	P45974	858 aa		6.9	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	SETDB2	Q96T68	719 aa		6.9	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMD1	Q99460	953 aa		6.9	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		6.9	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		6.9	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	EHHADH	Q08426	723 aa		6.89	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMD2	Q13200	908 aa		6.89	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	GJD3	Q8N144	294 aa		6.89	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		6.89	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	CITED4	Q96RK1	184 aa		6.89	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		6.89	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	6.89	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		6.88	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	SASH3	O75995	380 aa		6.88	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	FGD1	P98174	961 aa		6.88	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	PLCB3	Q01970	1234 aa		6.88	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	ARID5A	Q03989	594 aa		6.88	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	C8orf34	Q49A92	452 aa		6.88	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	TTC16	Q8NEE8	873 aa		6.88	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		6.88	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	IGF1R	P08069	1367 aa		6.88	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616		A6NHS1	94 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP2K3	P46734	347 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	XKR5	Q6UX68	686 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	BHMT	Q93088	406 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM129B	Q96TA1	746 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	EFCC1	Q9HA90	598 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	EEA1	Q15075	1411 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF27	Q86VH2	1401 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR182	O15218	404 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	PDE3B	Q13370	1112 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	SOGA3	Q5TF21	947 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	NLRP13	Q86W25	1043 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	TMC1	Q8TDI8	760 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	PNMA5	Q96PV4	448 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	NFKB1	P19838	968 aa		6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	ITGAE	P38570	1179 aa		6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	NEUROD1	Q13562	356 aa		6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF394	Q53GI3	561 aa		6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	SYT9	Q86SS6	491 aa		6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFAT	Q9P243	1243 aa		6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	6.85	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		6.85	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	RARA	P10276	462 aa		6.85	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	ARAF	P10398	606 aa		6.85	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	HSD3B2	P26439	372 aa		6.85	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	6.85	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	6.85	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		6.85	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		6.85	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	ELP3	Q9H9T3	547 aa		6.85	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		6.85	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	KLF15	Q9UIH9	416 aa		6.85	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		6.85	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		6.84	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP3K6	O95382	1288 aa		6.84	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAMTS2	O95450	1211 aa		6.84	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	FGR	P09769	529 aa		6.84	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC181	Q5TID7	509 aa		6.84	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		6.84	□□□□□ -1.31
EFHC1-223	ENST00000636616	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	6.84	□□□□□ -1.32
EFHC1-223	ENST00000636616	GRIN2B	Q13224	1484 aa		6.84	□□□□□ -1.32

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