RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 CALML3P27482 149 aa23.05■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.05■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.04■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 MAP3K9P80192 1104 aa23.04■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 N4BP3O15049 544 aa23.04■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 TTC6Q86TZ1 520 aa23.04■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 JAG2Q9Y219 1238 aa23.04■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.04■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 USP25Q9UHP3 1055 aa23.04■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 ZSCAN30Q86W11 494 aa23.03■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 MYZAPP0CAP1 466 aa23.03■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 TCHPQ9BT92 498 aa23.03■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 UFL1O94874 794 aa23.03■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 SH2D4AQ9H788 454 aa23.03■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1W2PP64 1363 aa23.03■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF165P49910 485 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 PLCD4Q9BRC7 762 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA0556O60303 1618 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 ACTN2P35609 894 aa23.02■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 SPAG5Q96R06 1193 aa23.02■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 CAVIN2O95810 425 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 ASIC1P78348 528 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 TMX1Q9H3N1 280 aa23.01■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 KRT79Q5XKE5 535 aa23■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM75PA6NK02 468 aa23■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 KRT2P35908 639 aa23■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 GNA11P29992 359 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 VAMP4O75379 141 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 TEX11Q8IYF3 940 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF790Q6PG37 636 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 TSPYL6Q8N831 410 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 AKR1B10O60218 316 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 FAM89AQ96GI7 184 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 KRT24Q2M2I5 525 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 CEP85Q6P2H3 762 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 GGA1Q9UJY5 639 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 PSMA7O14818 248 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 FAM13AO94988 1023 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 LMAN1P49257 510 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 PICK1Q9NRD5 415 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 ITGA6P23229 1130 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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CTDP1-208ENST00000613122 ORAI2Q96SN7 254 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 PTPRKQ15262 1439 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 ABCC2Q92887 1545 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF354CQ86Y25 554 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 SPAG1Q07617 926 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 ADAMTS12P58397 1594 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 SPECC1Q5M775 1068 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC45Q96CN5 670 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 PLVAPQ9BX97 442 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 ATP10AO60312 1499 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.95■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.95■■□□□ 1.27
CTDP1-208ENST00000613122 SBNO1A3KN83 1393 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 H0YIN7 160 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 MBD4O95243 580 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 STAMBPO95630 424 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 CHST3Q7LGC8 479 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 PDE8AO60658 829 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 MAST3O60307 1309 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.95■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CTDP1-208ENST00000613122 JADE2Q9NQC1 790 aa22.94■■□□□ 1.26
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