RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ELP1	O95163	1332 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ADCY9	O60503	1353 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	SRGAP3	O43295	1099 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	CPA1	P15085	419 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	GJB2	P29033	226 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	LTK	P29376	864 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	HOXC9	P31274	260 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	COPS2	P61201	443 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	DMTN	Q08495	405 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	NECTIN1	Q15223	517 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	CNTROB	Q8N137	903 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	MPND	Q8N594	471 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	SPG7	Q9UQ90	795 aa		5.92	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	FIBP	O43427	364 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	LIG1	P18858	919 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	AMPH	P49418	695 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	TYRO3	Q06418	890 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ME3	Q16798	604 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	BRICD5	Q6PL45	260 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	TTC6	Q86TZ1	520 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	MTR	Q99707	1265 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF3A	Q9Y496	699 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	MED23	Q9ULK4	1368 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	NCAPD2	Q15021	1401 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	MRC1	P22897	1456 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	SLIT1	O75093	1534 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	CACNA1F	O60840	1977 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ZPR1	O75312	459 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ALDH1L1	O75891	902 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC192	P0DO97	292 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF75D	P51815	510 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	SYCP1	Q15431	976 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP3K11	Q16584	847 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP2B3	Q16720	1220 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	NECAB1	Q8N987	351 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP4K1	Q92918	833 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	THAP11	Q96EK4	314 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	TBX22	Q9Y458	520 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	UTY	O14607	1347 aa		5.9	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		5.9	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		5.9	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	NFAT5	O94916	1531 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC27A2	O14975	620 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	PDC	P20941	246 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	PTGS1	P23219	599 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	RPS6KB1	P23443	525 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CDC25B	P30305	580 aa		5.89	□□□□□ -1.47

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