RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515737.5

SH3BP2-228, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,579 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-228ENST00000515737 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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SH3BP2-228ENST00000515737 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-228ENST00000515737 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-228ENST00000515737 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-228ENST00000515737 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-228ENST00000515737 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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SH3BP2-228ENST00000515737 KCNB2Q92953 911 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-228ENST00000515737 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.29■□□□□ 0.84
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SH3BP2-228ENST00000515737 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP2-228ENST00000515737 ZNF827Q17R98 1081 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP2-228ENST00000515737 WASHC4Q2M389 1173 aa20.25■□□□□ 0.83
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SH3BP2-228ENST00000515737 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.22■□□□□ 0.83
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SH3BP2-228ENST00000515737 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.22■□□□□ 0.83
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SH3BP2-228ENST00000515737 GYG1P46976 350 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-228ENST00000515737 AK2P54819 239 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-228ENST00000515737 ST5P78524 1137 aa20.21■□□□□ 0.83
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SH3BP2-228ENST00000515737 TSGA10IPQ3SY00 556 aa20.21■□□□□ 0.83
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SH3BP2-228ENST00000515737 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
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SH3BP2-228ENST00000515737 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-228ENST00000515737 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-228ENST00000515737 KRT32Q14532 448 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-228ENST00000515737 UBE3CQ15386 1083 aa20.18■□□□□ 0.82
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SH3BP2-228ENST00000515737 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-228ENST00000515737 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-228ENST00000515737 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-228ENST00000515737 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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