RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
SHQ1-204ENST00000468347 BNIP3Q12983 259 aa4.95□□□□□ -1.62
SHQ1-204ENST00000468347 KCNMB1Q16558 191 aa4.95□□□□□ -1.62
SHQ1-204ENST00000468347 DUSP27Q5VZP5 1158 aa4.95□□□□□ -1.62
SHQ1-204ENST00000468347 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SHQ1-204ENST00000468347 FLAD1Q8NFF5 587 aa4.95□□□□□ -1.62
SHQ1-204ENST00000468347 GATA6Q92908 595 aa4.95□□□□□ -1.62
SHQ1-204ENST00000468347 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SHQ1-204ENST00000468347 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa4.95□□□□□ -1.62
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SHQ1-204ENST00000468347 FAM117BQ6P1L5 589 aa4.94□□□□□ -1.62
SHQ1-204ENST00000468347 PI4K2BQ8TCG2 481 aa4.94□□□□□ -1.62
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SHQ1-204ENST00000468347 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
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SHQ1-204ENST00000468347 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
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SHQ1-204ENST00000468347 GTF2IP78347 998 aa4.91□□□□□ -1.62
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SHQ1-204ENST00000468347 SEC31BQ9NQW1 1179 aa4.91□□□□□ -1.62
SHQ1-204ENST00000468347 CYP27A1Q02318 531 aa4.9□□□□□ -1.63
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SHQ1-204ENST00000468347 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
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SHQ1-204ENST00000468347 CXorf38Q8TB03 319 aa4.88□□□□□ -1.63
SHQ1-204ENST00000468347 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
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SHQ1-204ENST00000468347 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SHQ1-204ENST00000468347 DDRGK1Q96HY6 314 aa4.87□□□□□ -1.63
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SHQ1-204ENST00000468347 ARSDP51689 593 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1-204ENST00000468347 NLRP12P59046 1061 aa4.86□□□□□ -1.63
SHQ1-204ENST00000468347 ATG14Q6ZNE5 492 aa4.86□□□□□ -1.63
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SHQ1-204ENST00000468347 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa4.84□□□□□ -1.63
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SHQ1-204ENST00000468347 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
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SHQ1-204ENST00000468347 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SHQ1-204ENST00000468347 CELA3BP08861 270 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1-204ENST00000468347 LINC00310P59036 64 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1-204ENST00000468347 PIP4K2BP78356 416 aa4.82□□□□□ -1.64
SHQ1-204ENST00000468347 PRKCQQ04759 706 aa4.82□□□□□ -1.64
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