RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418601.1

GTPBP1-202, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 810 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-202ENST00000418601 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.15■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.15■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 CRHR2Q13324 411 aa25.14■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 MXD3Q9BW11 206 aa25.14■■□□□ 1.62
GTPBP1-202ENST00000418601 XDHP47989 1333 aa25.13■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa25.13■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.13■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 FBXW7Q969H0 707 aa25.13■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.13■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 WNK4Q96J92 1243 aa25.13■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.13■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 CAP1Q01518 475 aa25.12■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.12■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.12■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.11■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 SP3Q02447 781 aa25.11■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 DACT2Q5SW24 774 aa25.11■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.11■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.11■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.11■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 MYCP01106 439 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.09■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 NBPF11Q86T75 865 aa25.09■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa25.09■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 MED23Q9ULK4 1368 aa25.08■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 ATP2B4P23634 1241 aa25.08■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.08■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 CEP290O15078 2479 aa25.08■■□□□ 1.61
GTPBP1-202ENST00000418601 SPEF2Q9C093 1822 aa25.07■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 MAP3K11Q16584 847 aa25.06■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.06■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 KRT24Q2M2I5 525 aa25.05■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.05■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.04■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.04■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 OTOFQ9HC10 1997 aa25.04■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 GJA5P36382 358 aa25.03■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.03■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.03■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.02■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.02■■□□□ 1.6
GTPBP1-202ENST00000418601 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa25.01■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 DPF3Q92784 378 aa25.01■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 PTPN18Q99952 460 aa25.01■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 MMP14P50281 582 aa25■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 ARHGEF6Q15052 776 aa25■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 SH3TC2Q8TF17 1288 aa25■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.99■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 UNCXA6NJT0 531 aa24.98■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 PDE8AO60658 829 aa24.98■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 RIPK4P57078 832 aa24.98■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 COA1Q9GZY4 146 aa24.98■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 COL6A3P12111 3177 aa24.97■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 SHISA4Q96DD7 197 aa24.96■■□□□ 1.59
GTPBP1-202ENST00000418601 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 DLGAP5Q15398 846 aa24.95■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.95■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.95■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 PRO3102Q9H379 93 aa24.95■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.94■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.94■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.94■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 HYPKQ9NX55 129 aa24.94■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.93■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.93■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.93■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 OPTNQ96CV9 577 aa24.93■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 ELP3Q9H9T3 547 aa24.93■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.93■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 CLRN2A0PK11 232 aa24.92■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 GTF2IP78347 998 aa24.92■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 GOLGA2Q08379 1002 aa24.92■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 MYD88Q99836 296 aa24.92■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.91■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.91■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 VEZTQ9HBM0 779 aa24.91■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 MYH3P11055 1940 aa24.9■■□□□ 1.58
GTPBP1-202ENST00000418601 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
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