RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC5A1P13866 664 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF20Q5VTR2 975 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 MAST3O60307 1309 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 LAMA4Q16363 1823 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 CHRNDQ07001 517 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 DOCK2Q92608 1830 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 M0R2C6 588 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 MCM4P33991 863 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 RUFY3Q7L099 469 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 EP400Q96L91 3159 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 VPS53Q5VIR6 699 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 OSBP2Q969R2 916 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP5-204ENST00000412806 PSMA5P28066 241 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 DSCC1Q9BVC3 393 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 ADRA2BP18089 450 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 NLRP3Q96P20 1036 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 CYP21A2P08686 494 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 NUCB2P80303 420 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 PKP1Q13835 747 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 NFIXQ14938 502 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 WASHC4Q2M389 1173 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 APPBP2Q92624 585 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 RASGRF1Q13972 1273 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 SPATA5Q8NB90 893 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 LARGE1O95461 756 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 RPS6KB1P23443 525 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 ADD2P35612 726 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 BCAMP50895 628 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 KRT32Q14532 448 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 PROM2Q8N271 834 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.76■■□□□ 1.72
SH3BP5-204ENST00000412806 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 TXNRD1Q16881 649 aa25.76■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 GBP4Q96PP9 640 aa25.76■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 NPHP1O15259 732 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 FOXP2O15409 715 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 GYS1P13807 737 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 NEK1Q96PY6 1258 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A0G2JLW4 131 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 TM4SF1P30408 202 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 UBE4AQ14139 1066 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 GPAA1O43292 621 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 PDE6AP16499 860 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 UBE3CQ15386 1083 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 CNBD1Q8NA66 436 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
SH3BP5-204ENST00000412806 ME3Q16798 604 aa25.71■■□□□ 1.71
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