RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNMT3LQ9UJW3 386 aa5.32□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDC14CA4D256 554 aa5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GREM1O60565 184 aa5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NXPE4Q6UWF7 544 aa5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KIAA0825Q8IV33 1275 aa5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GLIS3Q8NEA6 775 aa5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NEDD1Q8NHV4 660 aa5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CNKSR1Q969H4 720 aa5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KLRG1Q96E93 195 aa5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DEPDC7Q96QD5 511 aa5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BCO2Q9BYV7 579 aa5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZFP64Q9NPA5 681 aa5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RAB6BQ9NRW1 208 aa5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 STRIP2Q9ULQ0 834 aa5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARHGEF11O15085 1522 aa5.31□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MICAL2O94851 1124 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UPP2O95045 317 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PCSK2P16519 638 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTSQ03393 145 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LAMC2Q13753 1193 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TLR1Q15399 786 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C8orf34Q49A92 452 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GALNT12Q8IXK2 581 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VWA5B2Q8N398 1253 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 JMYQ8N9B5 988 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NT5C1AQ9BXI3 368 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC113Q9H0I3 377 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CHRDQ9H2X0 955 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EFR3BQ9Y2G0 817 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TLL2Q9Y6L7 1015 aa5.3□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VIL1P09327 827 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FSHRP23945 695 aa5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CENPCQ03188 943 aa5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CLN3Q13286 438 aa5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SV2AQ7L0J3 742 aa5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NBPF15Q8N660 670 aa5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SH3TC2Q8TF17 1288 aa5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRIM52Q96A61 297 aa5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SHDQ96IW2 340 aa5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RHOVQ96L33 236 aa5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM74Q96NL1 305 aa5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FANCLQ9NW38 375 aa5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CNTN3Q9P232 1028 aa5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRKAG3Q9UGI9 489 aa5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CHMP3Q9Y3E7 222 aa5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MRVI1Q9Y6F6 885 aa5.29□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDGFRBP09619 1106 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MASP1P48740 699 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GYS2P54840 703 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SQSTM1Q13501 440 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GRM2Q14416 872 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARSHQ5FYA8 562 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IER5Q5VY09 327 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC116Q8IYX3 515 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRPM4Q8TD43 1214 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SNX29Q8TEQ0 813 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SUV39H2Q9H5I1 410 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPHS2Q9NP85 383 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM260Q9NX78 707 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM13BQ9NYF5 915 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PARP3Q9Y6F1 533 aa5.28□□□□□ -1.56
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ESYT3A0FGR9 886 aa5.27□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.27□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDC45O75419 566 aa5.27□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NR3C2P08235 984 aa5.27□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TXLNAP40222 546 aa5.27□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PCNX4Q63HM2 1172 aa5.27□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC155Q8N6L0 562 aa5.27□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNAJC7Q99615 494 aa5.27□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 INPP5BP32019 993 aa5.26□□□□□ -1.57
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PWP1Q13610 501 aa5.26□□□□□ -1.57
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