RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 TMX1Q9H3N1 280 aa25.37■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 SOX12O15370 315 aa25.37■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 NOP2P46087 812 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 ME1P48163 572 aa25.37■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 NCAPHQ15003 741 aa25.36■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.36■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 SDF4Q9BRK5 362 aa25.36■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.36■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 A0A1W2PQ27 194 aa25.36■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 A0A1W2PQ64 194 aa25.36■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 A0A1W2PQD8 194 aa25.36■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.36■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 LCMT1Q9UIC8 334 aa25.36■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 CASQ1P31415 396 aa25.35■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.35■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 NEDD4P46934 1319 aa25.35■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 ADALQ6DHV7 355 aa25.34■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 SRLQ86TD4 932 aa25.34■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.34■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 ARFGAP3Q9NP61 516 aa25.34■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 SASH1O94885 1247 aa25.34■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 HOXB7P09629 217 aa25.34■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 FUT8Q9BYC5 575 aa25.34■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.34■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 TRIM66O15016 1216 aa25.33■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 NLRP12P59046 1061 aa25.33■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 C10orf67Q8IYJ2 551 aa25.33■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 CTDNEP1O95476 244 aa25.33■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 FANCCQ00597 558 aa25.33■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 CTR9Q6PD62 1173 aa25.33■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.33■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.33■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 NWD1Q149M9 1564 aa25.33■■□□□ 1.65
CLDN5-201ENST00000403084 COL15A1P39059 1388 aa25.32■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 YY1AP1Q9H869 796 aa25.32■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 ADAM21Q9UKJ8 722 aa25.32■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 NCAPD2Q15021 1401 aa25.32■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 ZSCAN12O43309 604 aa25.32■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 MAP3K9P80192 1104 aa25.32■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 EPC1Q9H2F5 836 aa25.32■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 PTPDC1A2A3K4 754 aa25.31■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 IKBKBO14920 756 aa25.31■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 NDUFA8P51970 172 aa25.31■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 RTEL1Q9NZ71 1219 aa25.31■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.31■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 TNRQ92752 1358 aa25.31■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 A0A1B0GVL5 298 aa25.31■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 VWA3AA6NCI4 1184 aa25.31■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 LAMA4Q16363 1823 aa25.3■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.3■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.3■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 RABGGTAQ92696 567 aa25.3■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 PTPRUQ92729 1446 aa25.3■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 ACTN2P35609 894 aa25.3■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 AMPHP49418 695 aa25.3■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 FOSBP53539 338 aa25.3■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 PARD6BQ9BYG5 372 aa25.3■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 MRFAP1Q9Y605 127 aa25.3■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.29■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.29■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 HSD3B7Q9H2F3 369 aa25.29■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 MRC1P22897 1456 aa25.28■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 H3BQF6 201 aa25.27■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 MAP2K7O14733 419 aa25.27■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 LMAN1P49257 510 aa25.27■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.27■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 CBFA2T2O43439 604 aa25.27■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 CYP21A2P08686 494 aa25.27■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.27■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa25.27■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.27■■□□□ 1.64
CLDN5-201ENST00000403084 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa25.26■■□□□ 1.63
CLDN5-201ENST00000403084 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CLDN5-201ENST00000403084 TMEM139Q8IV31 216 aa25.26■■□□□ 1.63
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC151A5D8V7 595 aa25.26■■□□□ 1.63
CLDN5-201ENST00000403084 ARHGAP6O43182 974 aa25.26■■□□□ 1.63
CLDN5-201ENST00000403084 GYS2P54840 703 aa25.26■■□□□ 1.63
CLDN5-201ENST00000403084 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.26■■□□□ 1.63
CLDN5-201ENST00000403084 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.26■■□□□ 1.63
CLDN5-201ENST00000403084 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.26■■□□□ 1.63
CLDN5-201ENST00000403084 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CLDN5-201ENST00000403084 ATP1A3P13637 1013 aa25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.7 ms