RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 IL15P40933 162 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM193AP78312 1265 aa10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 CAGE1Q8TC20 777 aa10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 BRMS1Q9HCU9 246 aa10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 JAG2Q9Y219 1238 aa10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 ATP7BP35670 1465 aa10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 FILIP1LQ4L180 1135 aa10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 PI16Q6UXB8 463 aa10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 MAP4K1Q92918 833 aa10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 ADGRB3O60242 1522 aa10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 LAMC1P11047 1609 aa10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 TAF5LO75529 589 aa10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 TMCO3Q6UWJ1 677 aa10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 MRVI1Q9Y6F6 885 aa10.03□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa10.02□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 KARSQ15046 597 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 GTF3C6Q969F1 213 aa10.02□□□□□ -0.8
ANKRD42-202ENST00000393389 ZBTB43O43298 467 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 GPS2Q13227 327 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 HSP90B2PQ58FF3 399 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 KBTBD3Q8NAB2 608 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 ATP10DQ9P241 1426 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 CBFA2T2O43439 604 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 DNA2P51530 1060 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM160A1Q05DH4 1040 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC102BQ68D86 513 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 G3V3G9 751 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 ATP2B2Q01814 1243 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 SCRN1Q12765 414 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 ELF2Q15723 593 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 DCAF8Q5TAQ9 597 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIM34Q9BYJ4 488 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 TM6SF1Q9BZW5 370 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 E7EWF7 191 aa10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 ZAP70P43403 619 aa10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 MAP3K12Q12852 859 aa10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC52A2Q9HAB3 445 aa10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 MED14O60244 1454 aa10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 ADAMTS2O95450 1211 aa10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 ADD1P35611 737 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 GOLGA8FQ08AF8 430 aa10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 EYA2O00167 538 aa10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 GPIHBP1Q8IV16 184 aa10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 KCNG4Q8TDN1 519 aa10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 STAMQ92783 540 aa10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 PDLIM2Q96JY6 352 aa10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa10.01□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 GSDMDP57764 484 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 POLA2Q14181 598 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 NECTIN1Q15223 517 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC102AQ96A19 550 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 CPS1P31327 1500 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 PRDM1O75626 825 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 HOXB7P09629 217 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 MFSD6Q6ZSS7 791 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 DHX58Q96C10 678 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 XAGE2Q96GT9 111 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 LZTFL1Q9NQ48 299 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 PTPRMP28827 1452 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 HECW2Q9P2P5 1572 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 GPAA1O43292 621 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 ATP5JP18859 108 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 ACSBG1Q96GR2 724 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 ALKQ9UM73 1620 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 NEO1Q92859 1461 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 SSH2Q76I76 1423 aa9.99□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 ADORA1P30542 326 aa9.99□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 DCAF5Q96JK2 942 aa9.99□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.99□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.99□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 CASQ1P31415 396 aa9.99□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF827Q17R98 1081 aa9.99□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 SMARCE1Q969G3 411 aa9.99□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 TTC14Q96N46 770 aa9.99□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 AIFM3Q96NN9 605 aa9.99□□□□□ -0.81
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms