RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368868.9

SELENBP1-201, Transcript of selenium binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,752 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1-201ENST00000368868 SCARF1Q14162 830 aa20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 CCDC102BQ68D86 513 aa20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 RUFY3Q7L099 469 aa20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 DSCC1Q9BVC3 393 aa20.6■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 MCM4P33991 863 aa20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 MCAMP43121 646 aa20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 ADCK5Q3MIX3 580 aa20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 NLRP3Q96P20 1036 aa20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 GBP4Q96PP9 640 aa20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 AK2P54819 239 aa20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.59■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 CHGBP05060 677 aa20.58■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SELENBP1-201ENST00000368868 PHF14O94880 888 aa20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 PHKA1P46020 1223 aa20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 CHRNDQ07001 517 aa20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 MAST3O60307 1309 aa20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 APPBP2Q92624 585 aa20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 TRIM37O94972 964 aa20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 WASHC4Q2M389 1173 aa20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 ANKRD1Q15327 319 aa20.55■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 PTMSP20962 102 aa20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 PI16Q6UXB8 463 aa20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 OSBP2Q969R2 916 aa20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 M0R2C6 588 aa20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 NPHP1O15259 732 aa20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 CPA1P15085 419 aa20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 SPATA5Q8NB90 893 aa20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 A0A1B0GUL6 1792 aa20.54■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 RPS6KB1P23443 525 aa20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 UBE4AQ14139 1066 aa20.53■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 ADD2P35612 726 aa20.52■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 UBE3CQ15386 1083 aa20.52■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 NEK1Q96PY6 1258 aa20.52■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.52■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SELENBP1-201ENST00000368868 CYP21A2P08686 494 aa20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 TAF1P21675 1872 aa20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 NFIXQ14938 502 aa20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.51■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 COL4A1P02462 1669 aa20.5■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 DOCK2Q92608 1830 aa20.49■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.49■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 SNAP23O00161 211 aa20.49■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 MAP3K12Q12852 859 aa20.49■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 RASGRF1Q13972 1273 aa20.49■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.49■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.49■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 BCAMP50895 628 aa20.49■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 TXNRD1Q16881 649 aa20.49■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 CNBD1Q8NA66 436 aa20.49■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.48■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 GPAA1O43292 621 aa20.47■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 GYS1P13807 737 aa20.47■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 PDE6AP16499 860 aa20.47■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.47■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.47■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 PLSCR1O15162 318 aa20.46■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 TM4SF1P30408 202 aa20.46■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 PKP1Q13835 747 aa20.46■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 GSE1Q14687 1217 aa20.46■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.46■□□□□ 0.87
SELENBP1-201ENST00000368868 LAMA4Q16363 1823 aa20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms