RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317216.2

EGR3-201, Transcript of early growth response 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene EGR3, Length 4,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3-201ENST00000317216 SNAP23O00161 211 aa14.65□□□□□ -0.06
EGR3-201ENST00000317216 ZAP70P43403 619 aa14.65□□□□□ -0.06
EGR3-201ENST00000317216 PTH1RQ03431 593 aa14.65□□□□□ -0.06
EGR3-201ENST00000317216 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.65□□□□□ -0.06
EGR3-201ENST00000317216 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
EGR3-201ENST00000317216 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
EGR3-201ENST00000317216 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
EGR3-201ENST00000317216 NTSR2O95665 410 aa14.64□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 TOMM22Q9NS69 142 aa14.64□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.64□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 IL25Q9H293 177 aa14.64□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.64□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.64□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 HSPA4P34932 840 aa14.64□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 ST5P78524 1137 aa14.64□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.64□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 PI16Q6UXB8 463 aa14.64□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.63□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 KIF2CQ99661 725 aa14.63□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 CPA1P15085 419 aa14.63□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 CHRNDQ07001 517 aa14.63□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 MAP3K12Q12852 859 aa14.63□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 CCDC102BQ68D86 513 aa14.63□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 RAI14Q9P0K7 980 aa14.63□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 PHKA1P46020 1223 aa14.62□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.62□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.62□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.62□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 TXNRD1Q16881 649 aa14.62□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 AIDAQ96BJ3 306 aa14.62□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.62□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 ITGB4P16144 1822 aa14.62□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 G3V3G9 751 aa14.62□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 H3BQV1 296 aa14.62□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.62□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 IFFO2Q5TF58 517 aa14.62□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 ZNF592Q92610 1267 aa14.62□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.61□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 KRT32Q14532 448 aa14.61□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 TMX3Q96JJ7 454 aa14.61□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 BECN2A8MW95 431 aa14.61□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 MPNDQ8N594 471 aa14.61□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.61□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 TRDNQ13061 729 aa14.61□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.61□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.61□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 RASEFQ8IZ41 740 aa14.6□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.6□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.6□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 CHGBP05060 677 aa14.6□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.6□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 BCAMP50895 628 aa14.6□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.6□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 HAND2P61296 217 aa14.6□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.6□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.6□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.6□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 TPM4P67936 248 aa14.59□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 STK3Q13188 491 aa14.59□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 NFIXQ14938 502 aa14.59□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.59□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.59□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 FSD2A1L4K1 749 aa14.59□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 SCARF1Q14162 830 aa14.59□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 SLC27A2O14975 620 aa14.58□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 SSFA2P28290 1259 aa14.58□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.58□□□□□ -0.07
EGR3-201ENST00000317216 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.58□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 ADRA2BP18089 450 aa14.58□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 GYG1P46976 350 aa14.58□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 SPATA5Q8NB90 893 aa14.58□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 FBXW7Q969H0 707 aa14.58□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 SERPINB2P05120 415 aa14.58□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.58□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 MAP4K1Q92918 833 aa14.58□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 MCAMP43121 646 aa14.57□□□□□ -0.08
EGR3-201ENST00000317216 BICD2Q8TD16 824 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms