RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 MICU3Q86XE3 530 aa15.65■□□□□ 0.1
TMOD1-201ENST00000259365 CEP57L1Q8IYX8 460 aa15.65■□□□□ 0.1
TMOD1-201ENST00000259365 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TMOD1-201ENST00000259365 PDILTQ8N807 584 aa15.65■□□□□ 0.1
TMOD1-201ENST00000259365 KBTBD3Q8NAB2 608 aa15.65■□□□□ 0.1
TMOD1-201ENST00000259365 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TMOD1-201ENST00000259365 CLIC4Q9Y696 253 aa15.65■□□□□ 0.1
TMOD1-201ENST00000259365 DENND2AQ9ULE3 1009 aa15.65■□□□□ 0.1
TMOD1-201ENST00000259365 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TMOD1-201ENST00000259365 COL15A1P39059 1388 aa15.65■□□□□ 0.1
TMOD1-201ENST00000259365 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CYP27B1O15528 508 aa15.64■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 STX1AQ16623 288 aa15.64■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC158Q5M9N0 1113 aa15.64■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 IFNKQ9P0W0 207 aa15.64■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PHKBQ93100 1093 aa15.64■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.64■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFA8P51970 172 aa15.63■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PCDHA7Q9UN72 937 aa15.63■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 M0R2C6 588 aa15.63■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SNAP23O00161 211 aa15.63■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PRC1O43663 620 aa15.63■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 OSBP2Q969R2 916 aa15.63■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 HAUS7Q99871 368 aa15.63■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 COPRSQ9NQ92 184 aa15.63■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 TRDNQ13061 729 aa15.63■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF609O15014 1411 aa15.62■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 DIP2BQ9P265 1576 aa15.62■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CTDNEP1O95476 244 aa15.62■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ADD1P35611 737 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.62■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ANO10Q9NW15 660 aa15.62■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 DIP2AQ14689 1571 aa15.62■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SERPINC1P01008 464 aa15.62■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ZAP70P43403 619 aa15.62■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 EVA1CP58658 441 aa15.62■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 DPCR1Q3MIW9 517 aa15.62■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PRDM11Q9NQV5 511 aa15.62■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SPTLC3Q9NUV7 552 aa15.62■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ERICH4A6NGS2 130 aa15.61■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 METTL24Q5JXM2 366 aa15.61■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 LRRC8AQ8IWT6 810 aa15.61■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.61■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ERBB3P21860 1342 aa15.61■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF213O14771 459 aa15.61■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SCARF1Q14162 830 aa15.61■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 MAST3O60307 1309 aa15.6■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 NBPF26B4DH59 902 aa15.6■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 NBPF14Q5TI25 921 aa15.6■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SYT10Q6XYQ8 523 aa15.6■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 NBPF15Q8N660 670 aa15.6■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.6■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 FGAP02671 866 aa15.6■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 FAM160A1Q05DH4 1040 aa15.6■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CFAP100Q494V2 611 aa15.6■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 AGLP35573 1532 aa15.59■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ELP1O95163 1332 aa15.59■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PFKFB2O60825 505 aa15.59■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ELF2Q15723 593 aa15.59■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa15.59■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CLIC6Q96NY7 704 aa15.59■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa15.59■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 XAGE2Q96GT9 111 aa15.59■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 EYA2O00167 538 aa15.58■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SPTLC2O15270 562 aa15.58■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.58■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 NUP133Q8WUM0 1156 aa15.58■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 TRERF1Q96PN7 1200 aa15.58■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
TMOD1-201ENST00000259365 MED23Q9ULK4 1368 aa15.58■□□□□ 0.08
TMOD1-201ENST00000259365 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
TMOD1-201ENST00000259365 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
TMOD1-201ENST00000259365 ATP1A3P13637 1013 aa15.58■□□□□ 0.08
TMOD1-201ENST00000259365 KCNB2Q92953 911 aa15.58■□□□□ 0.08
TMOD1-201ENST00000259365 DCAF5Q96JK2 942 aa15.58■□□□□ 0.08
TMOD1-201ENST00000259365 B4E1Z4 1266 aa15.57■□□□□ 0.08
TMOD1-201ENST00000259365 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
TMOD1-201ENST00000259365 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15.57■□□□□ 0.08
TMOD1-201ENST00000259365 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.57■□□□□ 0.08
TMOD1-201ENST00000259365 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
TMOD1-201ENST00000259365 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 334.1 ms