RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253458.11

GSE1-201, Transcript of Gse1 coiled-coil protein, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene GSE1, Length 7,495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSE1-201ENST00000253458 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 MYZAPP0CAP1 466 aa14.73□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.73□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 CEP135Q66GS9 1140 aa14.73□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 PAGR1Q9BTK6 254 aa14.73□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 MCM5P33992 734 aa14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 AAMPQ13685 434 aa14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 STK32BQ9NY57 414 aa14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 C6orf50Q9HD87 102 aa14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 APOBRQ0VD83 1088 aa14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 NACA2Q9H009 215 aa14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 GABPAQ06546 454 aa14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 TFCP2Q12800 502 aa14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.72□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 NAA25Q14CX7 972 aa14.71□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.71□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.71□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.71□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 IL2RBP14784 551 aa14.71□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 SYKP43405 635 aa14.71□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.71□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 ADGRL1O94910 1474 aa14.71□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.71□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 KSR1Q8IVT5 923 aa14.71□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.71□□□□□ -0.05
GSE1-201ENST00000253458 AKR1B10O60218 316 aa14.71□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.71□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 SATB1Q01826 763 aa14.7□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.7□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 ESR2Q92731 530 aa14.7□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 FERMT1Q9BQL6 677 aa14.7□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 CTR9Q6PD62 1173 aa14.7□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.7□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.7□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 ERMNQ8TAM6 284 aa14.7□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.7□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 DAPK1P53355 1430 aa14.7□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 KCNA4P22459 653 aa14.7□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.7□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 CCDC114Q96M63 670 aa14.69□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.063e-6■■■□□ 16.8
GSE1-201ENST00000253458 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 PRDM1O75626 825 aa14.69□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 BIRC3Q13489 604 aa14.69□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 MAFGO15525 162 aa14.69□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.69□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 CNBD1Q8NA66 436 aa14.69□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 SHTN1A0MZ66 631 aa14.69□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 ZSCAN12O43309 604 aa14.69□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 LETM2Q2VYF4 491 aa14.69□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.69□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 77
GSE1-201ENST00000253458 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 TNNQ9UQP3 1299 aa14.69□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 HGSO14964 777 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 ZNF174Q15697 407 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 ARAP1Q96P48 1450 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 CPA1P15085 419 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 GEN1Q17RS7 908 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 ADCY5O95622 1261 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 NYXQ9GZU5 481 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 WDR97A6NE52 1622 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 CCDC102BQ68D86 513 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 ABCC5O15440 1437 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 GRM8O00222 908 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 IGHDP01880 384 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 KCNQ4P56696 695 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GSE1-201ENST00000253458 TEX11Q8IYF3 940 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 220.7 ms