RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 FSD2A1L4K1 749 aa22.04■■□□□ 1.12
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HOXC11-201ENST00000243082 CCDC102BQ68D86 513 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 CERKQ8TCT0 537 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 BTAF1O14981 1849 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 LAMB2P55268 1798 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 PHKA1P46020 1223 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 SMIM5Q71RC9 77 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 NHSQ6T4R5 1651 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 NECAB1Q8N987 351 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 RGL2O15211 777 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 SYT1P21579 422 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 WASHC4Q2M389 1173 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 APPBP2Q92624 585 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 A0A0G2JLW4 131 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 FOXP2O15409 715 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 RPS6KA4O75676 772 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 GJB2P29033 226 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 ERFEQ4G0M1 354 aa22.01■■□□□ 1.11
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HOXC11-201ENST00000243082 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 SNAP23O00161 211 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 HSPA1LP34931 641 aa22.01■■□□□ 1.11
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HOXC11-201ENST00000243082 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 STX6O43752 255 aa22■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 SLC5A1P13866 664 aa22■■□□□ 1.11
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HOXC11-201ENST00000243082 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 AFF2P51816 1311 aa22■■□□□ 1.11
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HOXC11-201ENST00000243082 DTNBO60941 627 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 NARFQ9UHQ1 456 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 ADD2P35612 726 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 Q6ZUG5 572 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 SCN7AQ01118 1682 aa21.98■■□□□ 1.11
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HOXC11-201ENST00000243082 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
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HOXC11-201ENST00000243082 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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HOXC11-201ENST00000243082 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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HOXC11-201ENST00000243082 UBE3CQ15386 1083 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 SPATA5Q8NB90 893 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXC11-201ENST00000243082 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.96■■□□□ 1.11
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HOXC11-201ENST00000243082 MTMR6Q9Y217 621 aa21.95■■□□□ 1.1
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HOXC11-201ENST00000243082 F13A1P00488 732 aa21.94■■□□□ 1.1
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HOXC11-201ENST00000243082 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
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HOXC11-201ENST00000243082 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 LY75O60449 1722 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 SBF2Q86WG5 1849 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 ZPR1O75312 459 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
HOXC11-201ENST00000243082 PDE6AP16499 860 aa21.93■■□□□ 1.1
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