RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Casc1	Q6TDU8	730 aa		4.9	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ssh1	Q76I79	1042 aa		4.9	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trit1	Q80UN9	467 aa		4.9	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dars2	Q8BIP0	653 aa		4.9	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ubr7	Q8BU04	425 aa		4.9	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gnl3	Q8CI11	538 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pcdhb3	Q91XZ7	784 aa		4.9	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Stk39	Q9Z1W9	556 aa		4.9	□□□□□ -1.62
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cttnbp2	B9EJA2	1648 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cdc27	A2A6Q5	825 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Speer4d	L7N216	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfr	O88532	1074 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fancc	P50652	591 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Col6a1	Q04857	1025 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Asap2	Q7SIG6	958 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rexo1	Q7TT28	1213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Emilin2	Q8K482	1074 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Strbp	Q91WM1	672 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hps4	Q99KG7	671 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Jph3	Q9ET77	744 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prkab1	Q9R078	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zeb2	Q9R0G7	1215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slfn1	Q9Z0I7	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cftr	P26361	1476 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Syce3	B5KM66	88 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3755	K7N743	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hsp90ab1	P11499	724 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hoxc13	P50207	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ptpn5	P54830	541 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gmeb2	P58929	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Usp46	P62069	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cdv3	Q4VAA2	281 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gnptab	Q69ZN6	1235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Magea3	Q6T340	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem260	Q8BMD6	703 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dctn4	Q8CBY8	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Caskin2	Q8VHK1	1201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mrpl11	Q9CQF0	192 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Chit1	Q9D7Q1	464 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lrrc46	Q9DAP0	323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cenph	Q9QYM8	241 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pde3a	Q9Z0X4	1141 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	A030014E15Rik	A0A1Y7VJV2	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm3676	D3Z236	184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm4307	E9PZY4	289 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dntt	P09838	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cyp17a1	P27786	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smyd5	Q3TYX3	416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trim80	Q3V061	624 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Brinp3	Q499E0	766 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kif3b	Q61771	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kazn	Q69ZS8	779 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sez6l	Q6P1D5	963 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Shq1	Q7TMX5	569 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rxfp4	Q7TQP4	414 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbcel	Q8C5W3	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eva1a	Q91WM6	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hao2	Q9NYQ2	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	H2-Bl	V9GXR0	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Top2b	Q64511	1612 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cux2	P70298	1426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Brd4	Q9ESU6	1400 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clspn	Q80YR7	1315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm8926	L7MUE8	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppp1r15a	P17564	657 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Calca	P70160	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nell1	Q2VWQ2	810 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sema3g	Q4LFA9	780 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Jakmip3	Q5DTN8	844 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Klf4	Q60793	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rint1	Q8BZ36	792 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kctd2	Q8CEZ0	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccar2	Q8VDP4	922 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Traf7	Q922B6	594 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gfod2	Q9CYH5	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Apip	Q9WVQ5	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbc1d8b	A3KGB4	1114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pnmal2	G3X9N3	661 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	L3mbtl2	P59178	703 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ipcef1	Q5DU31	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nnt	Q61941	1086 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ovgp1	Q62010	721 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc148	Q6P5U8	527 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Efr3b	Q6ZQ18	817 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Taok3	Q8BYC6	898 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem266	Q8BZB3	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ano2	Q8CFW1	1002 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Parn	Q8VDG3	624 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dis3	Q9CSH3	958 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tsc1	Q9EP53	1161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Scyl1	Q9EQC5	806 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prl2a1	Q9JHK0	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ap3b2	Q9JME5	1082 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Catsper2	A2ARP9	588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ttll3	A4Q9E5	927 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	9630041A04Rik	D3Z3U4	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pot1b	H7BX60	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trim43c	P86449	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Col9a2	Q07643	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rnf166	Q3U9F6	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 159.8 ms