RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021227.5

Ankrd40-201, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd40, Length 1,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Eya2O08575 532 aa20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 HunkO88866 714 aa20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Hs1bp3Q3TC93 395 aa20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Abhd15Q5F2F2 459 aa20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Agtpbp1Q641K1 1218 aa20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Fbxo3Q9DC63 480 aa20.28■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Gpr182P43142 395 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Il15P48346 162 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Ftl2P49945 183 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Terf1P70371 421 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Atp8a2P98200 1148 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Oog3Q3UWY1 500 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Trim27Q62158 513 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 SisF8VQM5 1818 aa20.27■□□□□ 0.84
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Col3a1P08121 1464 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Kifc2O08672 792 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Plbd2Q3TCN2 594 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Large2Q5XPT3 690 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Jarid2Q62315 1234 aa20.26■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Arrdc4A0A0B4J1F4 415 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Bin2D3Z6Q9 489 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Mcmdc2E9Q956 681 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Usp17lbE9Q9U0 468 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Csrnp3P59055 597 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Mxd3Q80US8 206 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Tmem143Q8VD26 458 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Prg3Q9JL95 222 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Abcc4E9Q236 1325 aa20.25■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Nlrp1aQ2LKU9 1182 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Cog5Q8C0L8 829 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Trappc12Q8K2L8 797 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Zbtb3Q91X45 518 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Ndfip2Q91ZP6 311 aa20.24■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Csrnp1P59054 583 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Znf692Q3U381 531 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Mansc4Q3UU94 337 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Wwc1Q5SXA9 1104 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Atg9aQ68FE2 551 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Cluap1Q8R3P7 413 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Tmc2Q8R4P4 888 aa20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Ccdc51Q3URS9 406 aa20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Rlbp1Q9Z275 317 aa20.22■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Podnl1Q6P3Y9 559 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Dhx38Q80X98 1228 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Zkscan8Q8BSL0 588 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 LratQ9JI60 231 aa20.21■□□□□ 0.83
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 NrapQ80XB4 1728 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 AU019823E9PUQ3 292 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Gsdma2Q32M21 443 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Sh3bp5Q9Z131 463 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Scn11aQ9R053 1765 aa20.2■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Pde8bE9Q4S1 865 aa20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Speer4dL7N216 212 aa20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Hoxa7P02830 229 aa20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 GabrdP22933 449 aa20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Casp1P29452 402 aa20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Kcnh8P59111 1102 aa20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Znf18Q810A1 556 aa20.19■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Mageb2A2AHM0 380 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Traf5P70191 558 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Plekhf1Q3TB82 279 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Znf697Q569E7 569 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Mctp2Q5RJH2 878 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 NfkbibQ60778 359 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Tll1Q62381 1013 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Fchsd1Q6PFY1 688 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Pxylp1Q8BHA9 480 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Lman1lQ8VCD3 505 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Tmem79Q9D709 391 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Phrf1A6H619 1682 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Peak1Q69Z38 1735 aa20.18■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Usp17ldG5E8G2 545 aa20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Usp17lcG5E8I7 545 aa20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Ets1P27577 440 aa20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Atl3Q91YH5 541 aa20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Pde4aO89084 844 aa20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Wnt10bP48614 389 aa20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Irf6P97431 467 aa20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Ttll12Q3UDE2 639 aa20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 SkilQ60665 675 aa20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 WdpcpQ8C456 722 aa20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Sirt2Q8VDQ8 389 aa20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Atp2b3Q0VF55 1220 aa20.15■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa20.15■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Cgnl1Q6AW69 1298 aa20.15■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Fam102bQ8BQS4 339 aa20.15■□□□□ 0.82
Ankrd40-201ENSMUST00000021227 Slc44a4Q91VA1 707 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53 ms