RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Flvcr2Q91X85 551 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cnih4Q9CX13 139 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prps1Q9D7G0 318 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rrp8Q9DB85 457 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lgals8Q9JL15 316 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gde1Q9JL56 331 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tcea2Q9QVN7 299 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cldn13Q9Z0S4 211 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr911-ps1A0A140T8K0 311 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr547E9PXN3 311 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr613E9PYB4 317 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8126E9Q1N7 198 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm6619F6URP1 175 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm20696H3BJN7 74 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PdynO35417 248 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ighg1P01869 393 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rab19P35294 217 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1286Q7TQY2 305 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1282Q7TQY5 305 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr275Q7TS18 319 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CslQ80X68 466 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cldn34b3Q80ZS5 209 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Clba1Q8BHN9 321 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fbxo9Q8BK06 437 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Srrm4Q8BKA3 608 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pomt1Q8R2R1 746 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr672Q8VG28 312 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HypmQ9CR04 117 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TheglQ9DA15 459 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cldn12Q9ET43 244 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm11214V9GX06 183 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 KcpQ3U492 1550 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm29797A0A140LIA7 188 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SrsxB2RZI1 361 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mptx2D3YYJ7 219 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3543D3Z235 184 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Glp1rO35659 463 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Alox5apP30355 161 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adamts15P59384 950 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Masp1P98064 704 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mtmr11Q3V1L6 700 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hormad2Q5SQP1 306 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CishQ62225 257 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp180Q6NZI9 655 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kiaa0895Q7TQE7 519 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kctd9Q80UN1 339 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem108Q8BHE4 574 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdadc1Q8BMD5 523 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q8BTC1 67 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrrc10Q8K3W2 274 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr135Q8VEY4 312 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lnx2Q91XL2 687 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rab5aQ9CQD1 215 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcbd2Q9CZL5 136 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SlirpQ9D8T7 112 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fzd5Q9EQD0 585 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Taf8Q9EQH4 308 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ppp1r1aQ9ERT9 171 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Skp1Q9WTX5 163 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spag17Q5S003 2320 aa8.97□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Col4a2P08122 1707 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr65A0A1B0GSF4 315 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scgb1b29D2XZ31 93 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wisp3D3Z5L9 354 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scgb1b20E9PWZ2 93 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dok2O70469 412 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ApelaP0DMC4 54 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TpbpaP13438 124 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Clec3bP43025 202 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cpt2P52825 658 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hoxc4Q08624 264 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r11Q3SXA2 299 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Thsd4Q3UTY6 1018 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr323Q5NCD0 323 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CelQ64285 599 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ap5m1Q8BJ63 490 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q8BR90 294 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P2ry10bQ8BY68 352 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Srpx2Q8R054 468 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1412Q8VET3 321 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1301Q8VGE7 312 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1Q8VGI1 314 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eva1aQ91WM6 156 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc7a13Q91WN3 478 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrg1Q91XL1 342 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp61Q923D1 555 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lysmd1Q9D0E3 226 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc52a3Q9D6X5 460 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arfgap3Q9D8S3 523 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bola1Q9D8S9 137 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mfsd1Q9DC37 464 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 C1galt1c1Q9JMG2 316 aa8.96□□□□□ -0.97
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AsmtD3KU66 387 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r89O35199 507 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prl4a1O35256 227 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp1a2P00186 513 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il2raP01590 268 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P01809 118 aa8.96□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcsk4P29121 655 aa8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.4 ms