Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Cnih4Q9CX13 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cnih4Q9CX13 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cnih4Q9CX13 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cnih4Q9CX13 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cnih4Q9CX13 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnih4Q9CX13 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnih4Q9CX13 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnih4Q9CX13 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnih4Q9CX13 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnih4Q9CX13 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cnih4Q9CX13 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cnih4Q9CX13 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnih4Q9CX13 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cnih4Q9CX13 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cnih4Q9CX13 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnih4Q9CX13 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cnih4Q9CX13 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnih4Q9CX13 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnih4Q9CX13 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnih4Q9CX13 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnih4Q9CX13 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnih4Q9CX13 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnih4Q9CX13 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnih4Q9CX13 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnih4Q9CX13 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnih4Q9CX13 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnih4Q9CX13 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnih4Q9CX13 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnih4Q9CX13 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnih4Q9CX13 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnih4Q9CX13 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cnih4Q9CX13 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cnih4Q9CX13 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnih4Q9CX13 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cnih4Q9CX13 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnih4Q9CX13 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cnih4Q9CX13 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnih4Q9CX13 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnih4Q9CX13 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnih4Q9CX13 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnih4Q9CX13 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cnih4Q9CX13 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cnih4Q9CX13 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cnih4Q9CX13 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cnih4Q9CX13 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnih4Q9CX13 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnih4Q9CX13 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cnih4Q9CX13 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cnih4Q9CX13 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cnih4Q9CX13 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cnih4Q9CX13 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnih4Q9CX13 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnih4Q9CX13 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnih4Q9CX13 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnih4Q9CX13 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cnih4Q9CX13 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cnih4Q9CX13 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnih4Q9CX13 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnih4Q9CX13 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cnih4Q9CX13 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cnih4Q9CX13 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cnih4Q9CX13 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnih4Q9CX13 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnih4Q9CX13 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cnih4Q9CX13 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnih4Q9CX13 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnih4Q9CX13 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnih4Q9CX13 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnih4Q9CX13 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnih4Q9CX13 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnih4Q9CX13 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnih4Q9CX13 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnih4Q9CX13 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnih4Q9CX13 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnih4Q9CX13 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnih4Q9CX13 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnih4Q9CX13 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnih4Q9CX13 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cnih4Q9CX13 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnih4Q9CX13 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnih4Q9CX13 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnih4Q9CX13 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnih4Q9CX13 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnih4Q9CX13 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnih4Q9CX13 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnih4Q9CX13 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnih4Q9CX13 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cnih4Q9CX13 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnih4Q9CX13 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnih4Q9CX13 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnih4Q9CX13 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cnih4Q9CX13 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnih4Q9CX13 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnih4Q9CX13 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnih4Q9CX13 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnih4Q9CX13 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnih4Q9CX13 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnih4Q9CX13 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnih4Q9CX13 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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