Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXA2

Vmn1r11, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r11Q3SXA2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Vmn1r11Q3SXA2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Vmn1r11Q3SXA2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Vmn1r11Q3SXA2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Vmn1r11Q3SXA2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Vmn1r11Q3SXA2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Vmn1r11Q3SXA2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Vmn1r11Q3SXA2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Vmn1r11Q3SXA2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Vmn1r11Q3SXA2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Vmn1r11Q3SXA2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vmn1r11Q3SXA2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Vmn1r11Q3SXA2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vmn1r11Q3SXA2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Vmn1r11Q3SXA2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vmn1r11Q3SXA2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vmn1r11Q3SXA2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vmn1r11Q3SXA2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vmn1r11Q3SXA2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vmn1r11Q3SXA2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vmn1r11Q3SXA2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vmn1r11Q3SXA2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vmn1r11Q3SXA2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Vmn1r11Q3SXA2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vmn1r11Q3SXA2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vmn1r11Q3SXA2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Vmn1r11Q3SXA2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Vmn1r11Q3SXA2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Vmn1r11Q3SXA2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vmn1r11Q3SXA2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vmn1r11Q3SXA2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vmn1r11Q3SXA2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vmn1r11Q3SXA2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Vmn1r11Q3SXA2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vmn1r11Q3SXA2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vmn1r11Q3SXA2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vmn1r11Q3SXA2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Vmn1r11Q3SXA2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vmn1r11Q3SXA2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vmn1r11Q3SXA2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vmn1r11Q3SXA2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Vmn1r11Q3SXA2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vmn1r11Q3SXA2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vmn1r11Q3SXA2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Vmn1r11Q3SXA2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vmn1r11Q3SXA2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Vmn1r11Q3SXA2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vmn1r11Q3SXA2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vmn1r11Q3SXA2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vmn1r11Q3SXA2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vmn1r11Q3SXA2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vmn1r11Q3SXA2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vmn1r11Q3SXA2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vmn1r11Q3SXA2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vmn1r11Q3SXA2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vmn1r11Q3SXA2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vmn1r11Q3SXA2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vmn1r11Q3SXA2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Vmn1r11Q3SXA2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vmn1r11Q3SXA2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vmn1r11Q3SXA2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vmn1r11Q3SXA2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Vmn1r11Q3SXA2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vmn1r11Q3SXA2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vmn1r11Q3SXA2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vmn1r11Q3SXA2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vmn1r11Q3SXA2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vmn1r11Q3SXA2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vmn1r11Q3SXA2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vmn1r11Q3SXA2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Vmn1r11Q3SXA2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vmn1r11Q3SXA2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vmn1r11Q3SXA2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vmn1r11Q3SXA2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Vmn1r11Q3SXA2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r11Q3SXA2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r11Q3SXA2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn1r11Q3SXA2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vmn1r11Q3SXA2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r11Q3SXA2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r11Q3SXA2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r11Q3SXA2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r11Q3SXA2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r11Q3SXA2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r11Q3SXA2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r11Q3SXA2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn1r11Q3SXA2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vmn1r11Q3SXA2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vmn1r11Q3SXA2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r11Q3SXA2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r11Q3SXA2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn1r11Q3SXA2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r11Q3SXA2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r11Q3SXA2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r11Q3SXA2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Vmn1r11Q3SXA2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn1r11Q3SXA2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn1r11Q3SXA2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r11Q3SXA2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vmn1r11Q3SXA2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms