Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXA2

Vmn1r11, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r11Q3SXA2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,55■■■□□ 2,8
Vmn1r11Q3SXA2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Vmn1r11Q3SXA2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Vmn1r11Q3SXA2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Vmn1r11Q3SXA2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Vmn1r11Q3SXA2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Vmn1r11Q3SXA2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,95■■■□□ 2,22
Vmn1r11Q3SXA2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Vmn1r11Q3SXA2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Vmn1r11Q3SXA2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Vmn1r11Q3SXA2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Vmn1r11Q3SXA2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
Vmn1r11Q3SXA2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Vmn1r11Q3SXA2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,98■■■□□ 2,07
Vmn1r11Q3SXA2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Vmn1r11Q3SXA2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Vmn1r11Q3SXA2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Vmn1r11Q3SXA2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Vmn1r11Q3SXA2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Vmn1r11Q3SXA2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Vmn1r11Q3SXA2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Vmn1r11Q3SXA2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Vmn1r11Q3SXA2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Vmn1r11Q3SXA2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Vmn1r11Q3SXA2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Vmn1r11Q3SXA2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Vmn1r11Q3SXA2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Vmn1r11Q3SXA2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Vmn1r11Q3SXA2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Vmn1r11Q3SXA2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Vmn1r11Q3SXA2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Vmn1r11Q3SXA2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Vmn1r11Q3SXA2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Vmn1r11Q3SXA2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Vmn1r11Q3SXA2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Vmn1r11Q3SXA2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Vmn1r11Q3SXA2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Vmn1r11Q3SXA2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Vmn1r11Q3SXA2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Vmn1r11Q3SXA2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Vmn1r11Q3SXA2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Vmn1r11Q3SXA2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Vmn1r11Q3SXA2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Vmn1r11Q3SXA2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,45■■□□□ 1,83
Vmn1r11Q3SXA2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Vmn1r11Q3SXA2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,32■■□□□ 1,8
Vmn1r11Q3SXA2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Vmn1r11Q3SXA2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Vmn1r11Q3SXA2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Vmn1r11Q3SXA2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Vmn1r11Q3SXA2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Vmn1r11Q3SXA2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Vmn1r11Q3SXA2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Vmn1r11Q3SXA2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Vmn1r11Q3SXA2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Vmn1r11Q3SXA2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Vmn1r11Q3SXA2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Vmn1r11Q3SXA2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Vmn1r11Q3SXA2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Vmn1r11Q3SXA2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Vmn1r11Q3SXA2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Vmn1r11Q3SXA2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
Vmn1r11Q3SXA2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Vmn1r11Q3SXA2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Vmn1r11Q3SXA2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Vmn1r11Q3SXA2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Vmn1r11Q3SXA2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Vmn1r11Q3SXA2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Vmn1r11Q3SXA2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Vmn1r11Q3SXA2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Vmn1r11Q3SXA2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Vmn1r11Q3SXA2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Vmn1r11Q3SXA2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Vmn1r11Q3SXA2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,45■■□□□ 1,66
Vmn1r11Q3SXA2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Vmn1r11Q3SXA2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Vmn1r11Q3SXA2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Vmn1r11Q3SXA2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Vmn1r11Q3SXA2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Vmn1r11Q3SXA2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Vmn1r11Q3SXA2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Vmn1r11Q3SXA2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Vmn1r11Q3SXA2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Vmn1r11Q3SXA2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Vmn1r11Q3SXA2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Vmn1r11Q3SXA2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Vmn1r11Q3SXA2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Vmn1r11Q3SXA2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Vmn1r11Q3SXA2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Vmn1r11Q3SXA2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Vmn1r11Q3SXA2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Vmn1r11Q3SXA2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Vmn1r11Q3SXA2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Vmn1r11Q3SXA2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Vmn1r11Q3SXA2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Vmn1r11Q3SXA2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Vmn1r11Q3SXA2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Vmn1r11Q3SXA2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Vmn1r11Q3SXA2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Vmn1r11Q3SXA2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,9 ms