RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636020.1

CLN6-212, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 2

Gene CLN6, Length 894 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-212ENST00000636020 TAS2R41P59536 307 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 FHL1Q13642 323 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 PCK2Q16822 640 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 GPR61Q9BZJ8 451 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.66□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 PRSS37A4D1T9 235 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 ACOT8O14734 319 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 ANGPTL7O43827 346 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 OR5F1O95221 314 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 ACSM4P0C7M7 580 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 IKZF1Q13422 519 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 KCNMB1Q16558 191 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 NAA40Q86UY6 237 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 GLB1L2Q8IW92 636 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 SDR9C7Q8NEX9 313 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 GJC3Q8NFK1 279 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 OR51A7Q8NH64 312 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 BPIFA2Q96DR5 249 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 CHID1Q9BWS9 393 aa14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CLN6-212ENST00000636020 TRAV27A0A087WT01 109 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 SELLP14151 372 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 ECH1Q13011 328 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 MALLQ13021 153 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 MPP2Q14168 576 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 MESTQ5EB52 335 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 Q6ZS46 218 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 MAVSQ7Z434 540 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 MICU2Q8IYU8 434 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 SPDL1Q96EA4 605 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 MUC13Q9H3R2 512 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 LHFPL6Q9Y693 200 aa14.64□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 HTR3EA5X5Y0 456 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 XKRYO14609 159 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 LCATP04180 440 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 CHRM2P08172 466 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 IFI30P13284 250 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 CRYBA2P53672 197 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 C11orf53Q8IXP5 236 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 LINC00482Q8N8I6 264 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 SLC26A7Q8TE54 656 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 LRRC29Q8WV35 223 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 SEH1LQ96EE3 360 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 Q96M85 177 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 RERGLQ9H628 205 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 GRHPRQ9UBQ7 328 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.63□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 SYNGR1O43759 233 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 SLC16A7O60669 478 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 TNFRSF1BP20333 461 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 BLMHQ13867 455 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 CYP51A1Q16850 503 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 ANKDD1AQ495B1 522 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 CORO6Q6QEF8 472 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 DLEU7Q6UYE1 221 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 THAP1Q9NVV9 213 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 ADA2Q9NZK5 511 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 TCF19Q9Y242 345 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 SH3GLB1Q9Y371 365 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 CSMD3Q7Z407 3707 aa14.62□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 HERC2O95714 4834 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 A6NDX4 124 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 VGLL3A8MV65 326 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 F5H5K5 113 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 CLIC3O95833 236 aa14.61□□□□□ -0.07
CLN6-212ENST00000636020 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms