RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 CELA3BP08861 270 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF20P17024 532 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 IL32P24001 234 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF529Q6P280 563 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAAF1Q8NEP3 725 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5D14Q8NGL3 314 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 S100ZQ8WXG8 99 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 SPSB4Q96A44 273 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
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CAPNS1-215ENST00000628018 DHRS7CA6NNS2 312 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 AIPO00170 330 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 RGS5O15539 181 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM127O75204 238 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 BMP4P12644 408 aa21.55■■□□□ 1.04
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CAPNS1-215ENST00000628018 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D28Q2M2D7 210 aa21.55■■□□□ 1.04
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CAPNS1-215ENST00000628018 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 OR51A2Q8NGJ7 313 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf35Q96D05 121 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 WDFY2Q96P53 400 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 MIXL1Q9H2W2 232 aa21.55■■□□□ 1.04
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CAPNS1-215ENST00000628018 ABCB9Q9NP78 766 aa21.55■■□□□ 1.04
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CAPNS1-215ENST00000628018 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 MEGF11A6BM72 1044 aa21.55■■□□□ 1.04
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CAPNS1-215ENST00000628018 AGFG2O95081 481 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 CD37P11049 281 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 WNT5AP41221 380 aa21.55■■□□□ 1.04
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CAPNS1-215ENST00000628018 TIMM23BQ5SRD1 257 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 DDI2Q5TDH0 399 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 PGAP1Q75T13 922 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 LAX1Q8IWV1 398 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 MFSD4AQ8N468 514 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A15Q9Y619 301 aa21.55■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 CFPP27918 469 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFSF8P32971 234 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC190Q86UF4 302 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM169BQ8N8A8 192 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1M1Q8NGA1 313 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFAND2BQ8WV99 257 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 S100PBPQ96BU1 408 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 HMG20AQ9NP66 347 aa21.54■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 ELOVL5Q9NYP7 299 aa21.54■■□□□ 1.04
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CAPNS1-215ENST00000628018 THBS4P35443 961 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 ETV6P41212 452 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM3AP98173 230 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 SPOCK1Q08629 439 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM27E3Q08E93 113 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 TNK1Q13470 666 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 HES5Q5TA89 166 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 TBCCD1Q9NVR7 557 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 PIGLQ9Y2B2 252 aa21.53■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 TPRP12270 2363 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
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CAPNS1-215ENST00000628018 ACKR3P25106 362 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF846Q147U1 533 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8B8Q15620 311 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF101Q8IZC7 436 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 NKAIN3Q8N8D7 197 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 OR13C9Q8NGT0 318 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP19Q96LK0 163 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 STARD10Q9Y365 291 aa21.52■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 J3QW42 95 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 HPGDSO60760 199 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 PAHP00439 452 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 FAHP16930 419 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 BDKRB2P30411 391 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP2K3P46734 347 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 GSK3AP49840 483 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 GLT8D1Q68CQ7 371 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 LYPD6Q86Y78 171 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 STEAP2Q8NFT2 490 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 PP6455Q8WZ26 134 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-215ENST00000628018 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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