RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa19.31■□□□□ 0.68
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PTPRM-211ENST00000580170 OR4C16Q8NGL9 310 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 GPX8Q8TED1 209 aa19.31■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHA2Q9HB19 425 aa19.31■□□□□ 0.68
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PTPRM-211ENST00000580170 DPF1Q92782 380 aa19.31■□□□□ 0.68
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PTPRM-211ENST00000580170 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
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PTPRM-211ENST00000580170 NT5CQ8TCD5 201 aa19.29■□□□□ 0.68
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF787Q6DD87 383 aa19.28■□□□□ 0.68
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PTPRM-211ENST00000580170 TEX101Q9BY14 249 aa19.28■□□□□ 0.68
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PTPRM-211ENST00000580170 MRGPRX1Q96LB2 322 aa19.28■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 PSENENQ9NZ42 101 aa19.27■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
PTPRM-211ENST00000580170 MICAL3Q7RTP6 2002 aa19.27■□□□□ 0.68
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