RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546664.2

ACSS3-202, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene ACSS3, Length 379 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3-202ENST00000546664 BCL2L1Q07817 233 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 Q0VFX4 171 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 ECH1Q13011 328 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 SPA17Q15506 151 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 TAB1Q15750 504 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 APOOLQ6UXV4 268 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 TMEM150AQ86TG1 271 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 PNKDQ8N490 385 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 NATD1Q8N6N6 113 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 GATD1Q8NB37 220 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 SUMF1Q8NBK3 374 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 OR8G5Q8NG78 346 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 OR52B6Q8NGF0 335 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 C16orf78Q8WTQ4 265 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 ARPC1AQ92747 370 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 CLDN23Q96B33 292 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 PAGE5Q96GU1 130 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 ZNF597Q96LX8 424 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 P2RX4Q99571 388 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 DOK1Q99704 481 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 RARRES2Q99969 163 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 RHNO1Q9BSD3 238 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 MS4A6AQ9H2W1 248 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 ABCC13Q9NSE7 274 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 GLTPQ9NZD2 209 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 MMP17Q9ULZ9 603 aa3.35□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 A0A1W2PRG6 482 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 MSGN1A6NI15 193 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 CEACAM18A8MTB9 384 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 ZNF878C9JN71 531 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 INAFM1C9JVW0 142 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 ARPC5O15511 151 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 FABP7O15540 132 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 UGT2B11O75310 529 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 MED6O75586 246 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 IGHV3-9P01782 118 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 IGHV4-59P01825 116 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 MT-ND4P03905 459 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 CD55P08174 381 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 TFPTP0C1Z6 253 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 LINC00614P0C842 121 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 CDH1P12830 882 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 ICAM2P13598 275 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 F8A1P23610 371 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 ELK4P28324 431 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 ARL2P36404 184 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 CDKN2DP55273 166 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 CST9Q5W186 159 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 ZNF790Q6PG37 636 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 TFAP2EQ6VUC0 442 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 GAPTQ8N292 157 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 ZADH2Q8N4Q0 377 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 TMEM199Q8N511 208 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 CLDN22Q8N7P3 220 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 OR4K17Q8NGC6 315 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 OR4C13Q8NGP0 309 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 FGF11Q92914 225 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 RCN3Q96D15 328 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 MRAP2Q96G30 205 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 VAT1Q99536 393 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 TIPINQ9BVW5 301 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 TM2D1Q9BX74 207 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 DDIT4Q9NX09 232 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 TAS2R13Q9NYV9 303 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 HHLA2Q9UM44 414 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 SLC7A11Q9UPY5 501 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa3.34□□□□□ -1.87
ACSS3-202ENST00000546664 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
ACSS3-202ENST00000546664 CCDC144AA2RUR9 1427 aa3.34□□□□□ -1.88
ACSS3-202ENST00000546664 USP6P35125 1406 aa3.34□□□□□ -1.88
ACSS3-202ENST00000546664 CACNA1FO60840 1977 aa3.33□□□□□ -1.88
ACSS3-202ENST00000546664 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.33□□□□□ -1.88
ACSS3-202ENST00000546664 ISPDA4D126 451 aa3.33□□□□□ -1.88
ACSS3-202ENST00000546664 CLDN24A6NM45 220 aa3.33□□□□□ -1.88
ACSS3-202ENST00000546664 C15orf61A6NNL5 157 aa3.33□□□□□ -1.88
ACSS3-202ENST00000546664 OR11H12B2RN74 326 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 187.4 ms