RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492973.1

TPR-208, Transcript of translocated promoter region, nuclear basket protein, humanhuman

TSL 2

Gene TPR, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPR-208ENST00000492973 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP5.97□□□□□ -1.45
TPR-208ENST00000492973 MOKQ9UQ07 419 aa5.97□□□□□ -1.45
TPR-208ENST00000492973 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa5.97□□□□□ -1.45
TPR-208ENST00000492973 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
TPR-208ENST00000492973 FKBP7Q9Y680 259 aa5.97□□□□□ -1.45
TPR-208ENST00000492973 ICE1Q9Y2F5 2266 aa5.97□□□□□ -1.45
TPR-208ENST00000492973 DOCK7Q96N67 2140 aa5.96□□□□□ -1.45
TPR-208ENST00000492973 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
TPR-208ENST00000492973 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 CENPBD1B2RD01 187 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 M0R3G1 203 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 SLC16A7O60669 478 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 ITGA5P08648 1049 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 SBK2P0C263 348 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 PGA4P0DJD7 388 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 PGA3P0DJD8 388 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 ATP6V1B1P15313 513 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 CTLA4P16410 223 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 IGFBP2P18065 325 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 PCMT1P22061 227 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 IGHV1-2P23083 117 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 DCKP27707 260 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 CRABP1P29762 137 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 CD79BP40259 229 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 CFHR3Q02985 330 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 RAB40BQ12829 278 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 BLMHQ13867 455 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 TSC22D1Q15714 1073 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 C4orf46Q504U0 113 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 THEM4Q5T1C6 240 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 RNLSQ5VYX0 342 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 CARD17Q5XLA6 110 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 FBXW9Q5XUX1 488 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 ZNF773Q6PK81 442 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 STAC2Q6ZMT1 411 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 Q6ZT83 130 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 AHSA2Q719I0 299 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 ADCK1Q86TW2 530 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 C20orf196Q8IYI0 205 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 STX19Q8N4C7 294 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 SYT14Q8NB59 555 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 OR4F15Q8NGB8 312 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 OR51L1Q8NGJ5 315 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 OR2T4Q8NH00 348 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 ZNF649Q9BS31 505 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 LINC00470Q9BZP3 86 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 SYT4Q9H2B2 425 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 MARCH7Q9H992 704 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 ELOVL5Q9NYP7 299 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 MALT1Q9UDY8 824 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 MED12LQ86YW9 2145 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 NOTCH2Q04721 2471 aa5.96□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 IRGMA1A4Y4 181 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 TVP23AA6NH52 213 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 OR6C65A6NJZ3 312 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 PRSS44E7EML9 344 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 C16orf97H3BN30 126 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 FADS2O95864 444 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 CLPTM1O96005 669 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 IGHG1P01857 330 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 TFP02787 698 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 QDPRP09417 244 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 COX5AP20674 150 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 UGT2B10P36537 528 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 MAP2K4P45985 399 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 RPL5P46777 297 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 ALDH3B2P48448 385 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 CSNK1A1P48729 337 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 HCCSP53701 268 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 FMODQ06828 376 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 GGTLC2Q14390 218 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 P2RY6Q15077 328 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 LCN1P1Q5VSP4 162 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 C9orf135Q5VTT2 229 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 XAF1Q6GPH4 301 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 KCTD8Q6ZWB6 473 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 SHFQ7M4L6 423 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 HDDC2Q7Z4H3 204 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 TIGD4Q8IY51 512 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 UBE2J2Q8N2K1 259 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 NANOGP1Q8N7R0 232 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 POMGNT2Q8NAT1 580 aa5.95□□□□□ -1.46
TPR-208ENST00000492973 OR51G2Q8NGK0 314 aa5.95□□□□□ -1.46
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