RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB27BO00194 218 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 S100A8P05109 93 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 SFTA3P0C7M3 94 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 RABIFP47224 123 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC6A9P48067 706 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF585AQ6P3V2 769 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 CHST4Q8NCG5 386 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 OR52N5Q8NH56 324 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 TSLPQ969D9 159 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF251Q9BRH9 671 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 LMAN1LQ9HAT1 526 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB22AQ9UL26 194 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 HHLA2Q9UM44 414 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa16.34■□□□□ 0.21
RALGPS1-208ENST00000424082 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 METTL21EPA6NDL7 271 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF806P0C7X5 589 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 THEGLP0DJG4 465 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PTAFRP25105 342 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 CD1CP29017 333 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 CYCSP99999 105 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM200AQ86VY9 491 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ROBO4Q8WZ75 1007 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM46BQ96A09 425 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SMIM8Q96KF7 97 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 OR11A1Q9GZK7 315 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TXNIPQ9H3M7 391 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SEC61A2Q9H9S3 476 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SMCO4Q9NRQ5 59 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 C5orf52A6NGY3 159 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 S100A9P06702 114 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 HLA-DOBP13765 273 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC6A8P48029 635 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TDGQ13569 410 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 FZD2Q14332 565 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SGCAQ16586 387 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC29A4Q7RTT9 530 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 LYPD6Q86Y78 171 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC00346Q8IVM7 164 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 MARCH1Q8TCQ1 289 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 MICU1Q9BPX6 476 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 EGLN1Q9GZT9 426 aa16.33■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SDK1Q7Z5N4 2213 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM131Q92545 1883 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAV20A0A0B4J274 112 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 IGLV3-19P01714 112 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 CBR1P16152 277 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCD3P28288 659 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 GLO1Q04760 184 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 RTN4RL2Q86UN3 420 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM151BQ8IW70 566 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 C15orf54Q8N8G6 183 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ADIPOR1Q96A54 375 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC46A1Q96NT5 459 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 R4GMQ9 66 aa16.32■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 FRG2CA6NGY1 282 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 C1orf196B1AJZ1 125 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 UBE2CO00762 179 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 IFNA6P05013 189 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 IL12BP29460 328 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 FMODQ06828 376 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SMCO1Q147U7 214 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SYT13Q7L8C5 426 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 BHLHE23Q8NDY6 225 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TCTN2Q96GX1 697 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 CNTD2Q9H8S5 307 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 OR2S2Q9NQN1 319 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 G6PC2Q9NQR9 355 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 OR5AC2Q9NZP5 309 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PMP2P02689 132 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 LYL1P12980 280 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 PAX6P26367 422 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 CCR5P51681 352 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 F2RL1P55085 397 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TAS2R31P59538 309 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ZP2Q05996 745 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 AWAT2Q6E213 333 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 DCXRQ7Z4W1 244 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 NAA40Q86UY6 237 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 TCEAL3Q969E4 200 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 C14orf79Q96F83 325 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 LANCL2Q9NS86 450 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 SOHLH2Q9NX45 425 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 OR52A1Q9UKL2 312 aa16.31■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 P2RY10O00398 339 aa16.3■□□□□ 0.2
RALGPS1-208ENST00000424082 MT-ATP6P00846 226 aa16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms