RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 ALG5Q9Y673 324 aa3.5□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJC13O75165 2243 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 C5orf63A6NC05 138 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 HMX3A6NHT5 357 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 XRCC3O43542 346 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 SULT1B1O43704 296 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 FSTP19883 344 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 MEOX1P50221 254 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 GRB2P62993 217 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 DTX1Q86Y01 620 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5D14Q8NGL3 314 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 EDARADDQ8WWZ3 215 aa3.5□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 ATG5Q9H1Y0 275 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 DPAGT1Q9H3H5 408 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 NUDT15Q9NV35 164 aa3.5□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 NCKAP5O14513 1909 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF407Q9C0G0 2248 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa3.5□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 PRR33A8MZF0 331 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 E9PLN8 166 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa3.5□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 HPNP05981 417 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 B4GALT1P15291 398 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 LHX2P50458 406 aa3.5□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 SCAND1P57086 179 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 PPIAP62937 165 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 ARG2P78540 354 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 CD83Q01151 205 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 C3AR1Q16581 482 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 CEACAM16Q2WEN9 425 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM166AQ6J272 317 aa3.5□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 BIVMQ86UB2 503 aa3.5□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 OR52N4Q8NGI2 321 aa3.5□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 OR6M1Q8NGM8 313 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 CHAC2Q8WUX2 184 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A28Q96A46 364 aa3.5□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 DEFB127Q9H1M4 99 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 CNTD2Q9H8S5 307 aa3.5□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 MOB1AQ9H8S9 216 aa3.5□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 DMXL1Q9Y485 3027 aa3.5□□□□□ -1.85
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LRRTM4-201ENST00000409088 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 ELFN2Q5R3F8 820 aa3.49□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.49□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa3.49□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM27BQ5VT28 67 aa3.49□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 C9orf135Q5VTT2 229 aa3.49□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa3.49□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 FAAP20Q6NZ36 180 aa3.49□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF813Q6ZN06 617 aa3.49□□□□□ -1.85
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa3.49□□□□□ -1.85
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