RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCKARP32238 428 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 RDH10Q8IZV5 341 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL17RDQ8NFM7 739 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 LILRB4Q8NHJ6 448 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF799Q96GE5 643 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLGRKTQ9HBL7 147 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 HMG20AQ9NP66 347 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR52A1Q9UKL2 312 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 STOMP27105 288 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAGEB1P43366 347 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC6A9P48067 706 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 ASCL1P50553 236 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 HGFACQ04756 655 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 Q499Y3 187 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 TIMM23BQ5SRD1 257 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 MTFR2Q6P444 385 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 TPRA1Q86W33 373 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 STEAP2Q8NFT2 490 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 NOX4Q9NPH5 578 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC25A15Q9Y619 301 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 RTTNQ86VV8 2226 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 NKX2-6A6NCS4 301 aa24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACOD1A6NK06 481 aa24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 C16orf97H3BN30 126 aa24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 CTDSP2O14595 271 aa24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 CELA3BP08861 270 aa24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF846Q147U1 533 aa24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 HSD17B12Q53GQ0 312 aa24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 DERL3Q96Q80 235 aa24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 OBP2BQ9NPH6 170 aa24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATPIF1Q9UII2 106 aa24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 AMDHD2Q9Y303 409 aa24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 SERPINA5P05154 406 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 ACSM4P0C7M7 580 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 OCM2P0CE71 109 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 COX5BP10606 129 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 CBR1P16152 277 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCNOP22674 350 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 TPTEP56180 551 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRSS45Q7RTY3 260 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 NR2C2APQ86WQ0 139 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 MFSD4AQ8N468 514 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR10AC1Q8NH08 325 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 GPR148Q8TDV2 347 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 AP3S1Q92572 193 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 PBOV1Q9GZY1 135 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 C5orf49A4QMS7 147 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 PIN1P1O15428 100 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 C22orf34Q6ZV56 151 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM57BQ71RH2 274 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAB1Q15750 504 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 BCL2L15Q5TBC7 163 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 ALKBH2Q6NS38 261 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR51A4Q8NGJ6 313 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 BORCS5Q969J3 196 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 POM121L2Q96KW2 1035 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF319Q9P2F9 582 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 C5orf63A6NC05 138 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 H3BSH0 61 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 J3QRK9 145 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 RGS5O15539 181 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 IGKV3-15P01624 115 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 APLNRP35414 380 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 SOX2P48431 317 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 DRAM2Q6UX65 266 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC30A7Q8NEW0 376 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 ORAI1Q96D31 301 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZG16O60844 167 aa24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 APOC1P02654 83 aa24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 TTRP02766 147 aa24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR10A3P58181 314 aa24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 OR8B12Q8NGG6 310 aa24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 MUCL1Q96DR8 90 aa24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 SRMP19623 302 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 RAB3BP20337 219 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPA1Q15181 289 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 ELMOD2Q8IZ81 293 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 MOB1AQ9H8S9 216 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 SNAI3Q3KNW1 292 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 PGAM5Q96HS1 289 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 CEP19Q96LK0 163 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC24A3Q9HC58 644 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10-202ENST00000380221 KCNJ16Q9NPI9 418 aa24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms