RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C3orf38Q5JPI3 329 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VPS36Q86VN1 386 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NLRP14Q86W24 1093 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM89BQ8N5H3 189 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRRC57Q8N9N7 239 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NCOA7Q8NI08 942 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GDAP1Q8TB36 358 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CALML6Q8TD86 181 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PYCR2Q96C36 320 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SDCCAG3Q96C92 435 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C16orf74Q96GX8 76 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM56Q96MV1 263 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR92Q96MX6 357 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR6C1Q96RD1 312 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNS3Q9BQ31 491 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CEP41Q9BYV8 373 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MROH8Q9H579 483 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ALG9Q9H6U8 611 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC40A1Q9NP59 571 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MS4A12Q9NXJ0 267 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MSRB1Q9NZV6 116 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLEC4AQ9UMR7 237 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNF11Q9Y3C5 154 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPR45Q9Y5Y3 372 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NISCHQ9Y2I1 1504 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TUBAL3A6NHL2 446 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CAPN14A8MX76 684 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 M0QXV9 152 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FBP2O00757 339 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLEC3AO75596 197 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AKAP3O75969 853 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRP72O76094 671 aaKnown RBP-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RHOP08100 348 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IQCF3P0C7M6 154 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD36P16671 472 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLCG1P19174 1290 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAOAP21397 527 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCNCP24863 283 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD82P27701 267 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HTR1BP28222 390 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GLRXP35754 106 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLA2G4AP47712 749 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCT3P49368 545 aaKnown RBP-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GATMP50440 423 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SSR4P51571 173 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCL18P55774 89 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CLDN18P56856 261 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACTR2P61160 394 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP1R1AQ13522 171 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZBED5Q49AG3 693 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MPP7Q5T2T1 576 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C6orf183Q5T699 404 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMCO4Q5TGY1 634 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLFN12LQ6IEE8 588 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DHRS11Q6UWP2 260 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q6ZTK2 550 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PGAP1Q75T13 922 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SSX7Q7RTT5 188 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMC5Q8IY18 1101 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SIRT6Q8N6T7 355 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C12orf29Q8N999 325 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHST4Q8NCG5 386 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR2AE1Q8NHA4 323 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYOZ3Q8TDC0 251 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GANCQ8TET4 914 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRYGNQ8WXF5 182 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR5P2Q8WZ92 322 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAL2Q969L2 176 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EXOC4Q96A65 974 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UBXN10Q96LJ8 280 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC38A1Q9H2H9 487 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DSN1Q9H410 356 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POMKQ9H5K3 350 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TBC1D13Q9NVG8 400 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EURLQ9NYK6 297 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMOD3Q9NYL9 352 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNIP1Q9NZI2 227 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM9Q9P0T7 183 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LZTS1Q9Y250 596 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa-4.47□□□□□ -3.13
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COQ4Q9Y3A0 265 aa-4.47□□□□□ -3.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms