RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598256.1

LTBP4-222, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-222	ENST00000598256	ABCD4	O14678	606 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	TBX1	O43435	398 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	CLDN1	O95832	211 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	LCAT	P04180	440 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	FAM157B	P0CG42	384 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	RGS6	P49758	472 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	NR1H2	P55055	460 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	HGFAC	Q04756	655 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SPOCK1	Q08629	439 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SPHAR	Q15513	63 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	FAM57B	Q71RH2	274 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	FCGR1B	Q92637	280 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	PGAM5	Q96HS1	289 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	OR5M11	Q96RB7	305 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SP140L	Q9H930	580 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	AKAP9	Q99996	3911 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	LCK	P06239	509 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	CD3E	P07766	207 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF35	P13682	527 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	CALCR	P30988	508 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	TAS2R43	P59537	309 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	NEDD8	Q15843	81 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SLC22A25	Q6T423	547 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	NAA40	Q86UY6	237 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ABHD4	Q8TB40	342 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	RORB	Q92753	470 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	FAM206A	Q9NX38	181 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SMPD2	O60906	423 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	PNP	P00491	289 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	HSMCR30	P0CW71	290 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SMIM18	P0DKX4	95 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	WNT5A	P41221	380 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	MMP16	P51512	607 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	WDR38	Q5JTN6	314 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	XAF1	Q6GPH4	301 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	RTTN	Q86VV8	2226 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256		E9PI62	339 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256		J3QW42	95 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	LALBA	P00709	142 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	COX6B1	P14854	86 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	PCMT1	P22061	227 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	PSMB9	P28065	219 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	PCSK6	P29122	969 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	RAD52	P43351	418 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	TGM4	P49221	684 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	BDH1	Q02338	343 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	TIGD6	Q17RP2	521 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	CCDC58	Q4VC31	144 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	COMMD2	Q86X83	199 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	ACBD4	Q8NC06	268 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	COG8	Q96MW5	612 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	OR10A2	Q9H208	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LTBP4-222	ENST00000598256	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21

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