RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 CTSFQ9UBX1 484 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2AT4A6NND4 320 aa24.1■■□□□ 1.45
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SH3BP2-221ENST00000511747 TSPAN9O75954 239 aa24.1■■□□□ 1.45
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SH3BP2-221ENST00000511747 SSX5O60225 188 aa24.05■■□□□ 1.44
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SH3BP2-221ENST00000511747 MBD2Q9UBB5 411 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 HRH3Q9Y5N1 445 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 PPIAP62937 165 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF529Q6P280 563 aa24.05■■□□□ 1.44
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