RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PQD3 144 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SIX6O95475 246 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 GCH1P30793 250 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 MLLT10P55197 1068 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 BDH1Q02338 343 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ASB5Q8WWX0 329 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TMEM18Q96B42 140 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 RAB9BQ9NP90 201 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 GLRX2Q9NS18 164 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TMED7Q9Y3B3 224 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PPK0 400 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SUSD5O60279 629 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 H2BFMP0C1H6 154 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ECI1P42126 302 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 GLO1Q04760 184 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ZNF266Q14584 549 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 OR7A5Q15622 319 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SSX7Q7RTT5 188 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 MFSD4AQ8N468 514 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 NDUFB11Q9NX14 153 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TTC28Q96AY4 2481 aa6.91□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 PIP5K1CO60331 668 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TOX4O94842 621 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 BPNT1O95861 308 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 HRGP04196 525 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CT45A8P0DMV1 189 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CT45A9P0DMV2 189 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 HTD2P86397 168 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 AQP6Q13520 282 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CARD17Q5XLA6 110 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 TXN2Q99757 166 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 ZFP64Q9NPA5 681 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CMC2Q9NRP2 79 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 PTNP21246 168 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 EVX1P49640 407 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SLC37A1P57057 533 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 NPSR1Q6W5P4 371 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.9□□□□□ -1.3
USP54-210ENST00000466048 A0A0A6YYH2 397 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 A6NJ64 397 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 FAM166BA8MTA8 275 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 M0QZK8 103 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 M0R082 166 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SYT7O43581 403 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR2J2O76002 312 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 MAS1P04201 325 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 RRASP10301 218 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CAV2P51636 162 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SRPXP78539 464 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 LTBQ06643 244 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 DCAF10Q5QP82 559 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 KDM8Q8N371 416 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 SLC39A7Q92504 469 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CORO2AQ92828 525 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 PRR14Q9BWN1 585 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ENY2Q9NPA8 101 aa6.9□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
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