RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 COX5AP20674 150 aa17.55■□□□□ 0.4
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ODC1-202ENST00000405333 CEP78Q5JTW2 689 aa17.51■□□□□ 0.39
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ODC1-202ENST00000405333 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa17.5■□□□□ 0.39
ODC1-202ENST00000405333 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa17.5■□□□□ 0.39
ODC1-202ENST00000405333 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
ODC1-202ENST00000405333 AGFG2O95081 481 aa17.5■□□□□ 0.39
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ODC1-202ENST00000405333 SOX6P35712 828 aa17.5■□□□□ 0.39
ODC1-202ENST00000405333 TMEM53Q6P2H8 277 aa17.5■□□□□ 0.39
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