RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbccd1Q640P7 552 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1133Q7TR44 313 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cggbp1Q8BHG9 167 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1132Q8VG97 308 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr646Q8VGW2 312 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptp4a3Q9D658 173 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cers4Q9D6J1 393 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kiaa0141Q9DCV6 510 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SigirrQ9JLZ8 409 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr545Q9WU94 316 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnj16Q9Z307 419 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1223A0A1L1SU13 311 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Emc8O70378 207 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccl4P14097 92 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rag2P21784 527 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rab11bP46638 218 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bbs12Q5SUD9 708 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zp3rQ60736 579 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clns1aQ61189 236 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hist2h2abQ64522 130 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnfsfm13Q8BXS2 410 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr1Q8K087 353 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1390Q8VGW9 311 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clec2dQ91V08 207 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Defb8Q91V82 60 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dnaja3Q99M87 480 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdca5Q9CPY3 264 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrit3W8DXL4 681 aa14.56□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm29797A0A140LIA7 188 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gng8P63078 70 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Map2k6P70236 334 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4930438A08RikQ5SPH3 536 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem158Q6F5E0 286 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1229Q7TQZ9 311 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 LssQ8BLN5 733 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MastlQ8C0P0 865 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4930447A16RikQ9D5F6 132 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdc40Q9DC48 579 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm17087V9GXQ2 156 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr419E9Q0Y7 313 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wdr25E9Q349 535 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prr23a1G3UW32 258 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r94K7N6X3 305 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ier3P46694 153 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cpne2P59108 548 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fgf11P70378 225 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Col10a1Q05306 680 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cbx5Q61686 191 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AstlQ6HA09 435 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Npepl1Q6NSR8 524 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abhd16bQ80YU0 474 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rspry1Q8BVR6 576 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr713Q920G5 324 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mettl18Q9CZ09 362 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Alkbh7Q9D6Z0 221 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rp2Q9EPK2 347 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sema7aQ9QUR8 664 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 GnmtQ9QXF8 293 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Polg2Q9QZM2 459 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bex3Q9WTZ9 124 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem178bM0QWJ9 172 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il9P15247 144 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nme1P15532 152 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnfrsf1bP25119 474 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr160Q3U3F9 336 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm14851Q5ERJ0 116 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pptc7Q6NVE9 310 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rcc1Q8VE37 421 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr47Q8VF18 321 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr800Q8VFH7 311 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mrgpra4Q91WW2 313 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TollipQ9QZ06 274 aa14.55□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ankrd60A2AMD2 318 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8159E9Q0R1 267 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lipo5F6QKH6 233 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm20696H3BJN7 74 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcrg-V1P06325 135 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ier2P17950 221 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pax2P32114 414 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hcrtr2P58308 460 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr884Q7TRE1 309 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mboat1Q8BH98 492 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SdhaQ8K2B3 664 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn1r230Q8R2A2 316 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf113a1Q8R3P8 341 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr836Q8VFJ3 317 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1501Q8VFQ3 315 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr763Q8VGC1 309 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snx18Q91ZR2 614 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lin37Q9D8N6 246 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Skint10A7TZG1 354 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CenpfE9Q3P4 2997 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 EdaO54693 391 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pias3O54714 628 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Muc13P19467 573 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fahd2Q3TC72 313 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Galk2Q68FH4 458 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mettl27Q8BGM4 238 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CenpoQ8K015 298 aa14.54□□□□□ -0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxl6Q9QXW0 535 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.4 ms