Protein–RNA interactions for Protein: P46694

Ier3, Radiation-inducible immediate-early gene IEX-1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier3P46694 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,73■■■□□ 2,83
Ier3P46694 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Ier3P46694 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Ier3P46694 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Ier3P46694 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Ier3P46694 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Ier3P46694 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Ier3P46694 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Ier3P46694 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Ier3P46694 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Ier3P46694 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Ier3P46694 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Ier3P46694 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Ier3P46694 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Ier3P46694 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ier3P46694 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Ier3P46694 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Ier3P46694 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ier3P46694 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ier3P46694 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Ier3P46694 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ier3P46694 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ier3P46694 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Ier3P46694 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Ier3P46694 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ier3P46694 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ier3P46694 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,52■■■□□ 2
Ier3P46694 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Ier3P46694 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
Ier3P46694 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ier3P46694 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Ier3P46694 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Ier3P46694 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Ier3P46694 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Ier3P46694 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Ier3P46694 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ier3P46694 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ier3P46694 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Ier3P46694 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ier3P46694 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ier3P46694 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Ier3P46694 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,74■■□□□ 1,87
Ier3P46694 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ier3P46694 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ier3P46694 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ier3P46694 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Ier3P46694 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Ier3P46694 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Ier3P46694 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Ier3P46694 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Ier3P46694 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Ier3P46694 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Ier3P46694 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Ier3P46694 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Ier3P46694 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1,75
Ier3P46694 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Ier3P46694 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Ier3P46694 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Ier3P46694 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Ier3P46694 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Ier3P46694 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Ier3P46694 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Ier3P46694 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Ier3P46694 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Ier3P46694 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ier3P46694 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ier3P46694 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Ier3P46694 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Ier3P46694 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Ier3P46694 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
Ier3P46694 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Ier3P46694 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,66■■□□□ 1,7
Ier3P46694 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Ier3P46694 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
Ier3P46694 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,68
Ier3P46694 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ier3P46694 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ier3P46694 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ier3P46694 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ier3P46694 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ier3P46694 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ier3P46694 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ier3P46694 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ier3P46694 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ier3P46694 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Ier3P46694 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ier3P46694 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ier3P46694 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Ier3P46694 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Ier3P46694 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Ier3P46694 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ier3P46694 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ier3P46694 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ier3P46694 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Ier3P46694 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Ier3P46694 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ier3P46694 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ier3P46694 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ier3P46694 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ier3P46694 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms