Protein–RNA interactions for Protein: Q05306

Col10a1, Collagen alpha-1(X) chain, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col10a1Q05306 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,29■■■■□ 3,08
Col10a1Q05306 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,56■■■□□ 2,64
Col10a1Q05306 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,6
Col10a1Q05306 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Col10a1Q05306 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Col10a1Q05306 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,3■■■□□ 2,44
Col10a1Q05306 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Col10a1Q05306 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Col10a1Q05306 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
Col10a1Q05306 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Col10a1Q05306 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Col10a1Q05306 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,95■■■□□ 2,23
Col10a1Q05306 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Col10a1Q05306 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,8■■■□□ 2,2
Col10a1Q05306 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,69■■■□□ 2,18
Col10a1Q05306 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Col10a1Q05306 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Col10a1Q05306 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Col10a1Q05306 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Col10a1Q05306 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Col10a1Q05306 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Col10a1Q05306 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Col10a1Q05306 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Col10a1Q05306 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Col10a1Q05306 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Col10a1Q05306 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Col10a1Q05306 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Col10a1Q05306 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Col10a1Q05306 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Col10a1Q05306 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Col10a1Q05306 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
Col10a1Q05306 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Col10a1Q05306 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Col10a1Q05306 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Col10a1Q05306 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Col10a1Q05306 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Col10a1Q05306 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Col10a1Q05306 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Col10a1Q05306 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Col10a1Q05306 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Col10a1Q05306 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Col10a1Q05306 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Col10a1Q05306 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Col10a1Q05306 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Col10a1Q05306 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Col10a1Q05306 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Col10a1Q05306 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,96■■□□□ 1,91
Col10a1Q05306 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Col10a1Q05306 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Col10a1Q05306 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Col10a1Q05306 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Col10a1Q05306 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Col10a1Q05306 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Col10a1Q05306 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Col10a1Q05306 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Col10a1Q05306 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Col10a1Q05306 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,6■■□□□ 1,85
Col10a1Q05306 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Col10a1Q05306 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Col10a1Q05306 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Col10a1Q05306 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Col10a1Q05306 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Col10a1Q05306 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Col10a1Q05306 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Col10a1Q05306 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Col10a1Q05306 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Col10a1Q05306 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Col10a1Q05306 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,35■■□□□ 1,81
Col10a1Q05306 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Col10a1Q05306 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Col10a1Q05306 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Col10a1Q05306 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Col10a1Q05306 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Col10a1Q05306 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Col10a1Q05306 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Col10a1Q05306 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Col10a1Q05306 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Col10a1Q05306 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Col10a1Q05306 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Col10a1Q05306 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Col10a1Q05306 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Col10a1Q05306 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Col10a1Q05306 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,95■■□□□ 1,75
Col10a1Q05306 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Col10a1Q05306 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Col10a1Q05306 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Col10a1Q05306 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Col10a1Q05306 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Col10a1Q05306 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Col10a1Q05306 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Col10a1Q05306 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Col10a1Q05306 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Col10a1Q05306 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Col10a1Q05306 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Col10a1Q05306 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Col10a1Q05306 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,66■■□□□ 1,7
Col10a1Q05306 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Col10a1Q05306 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Col10a1Q05306 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,64■■□□□ 1,7
Col10a1Q05306 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39,3 ms