Protein–RNA interactions for Protein: Q05306

Col10a1, Collagen alpha-1(X) chain, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col10a1Q05306 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Col10a1Q05306 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Col10a1Q05306 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Col10a1Q05306 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Col10a1Q05306 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Col10a1Q05306 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Col10a1Q05306 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Col10a1Q05306 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Col10a1Q05306 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Col10a1Q05306 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col10a1Q05306 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col10a1Q05306 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Col10a1Q05306 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col10a1Q05306 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Col10a1Q05306 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Col10a1Q05306 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Col10a1Q05306 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Col10a1Q05306 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Col10a1Q05306 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Col10a1Q05306 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Col10a1Q05306 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col10a1Q05306 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col10a1Q05306 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Col10a1Q05306 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col10a1Q05306 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col10a1Q05306 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Col10a1Q05306 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Col10a1Q05306 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Col10a1Q05306 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col10a1Q05306 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col10a1Q05306 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Col10a1Q05306 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col10a1Q05306 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col10a1Q05306 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col10a1Q05306 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col10a1Q05306 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col10a1Q05306 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col10a1Q05306 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col10a1Q05306 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col10a1Q05306 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Col10a1Q05306 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Col10a1Q05306 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col10a1Q05306 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Col10a1Q05306 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Col10a1Q05306 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Col10a1Q05306 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Col10a1Q05306 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Col10a1Q05306 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col10a1Q05306 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Col10a1Q05306 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Col10a1Q05306 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Col10a1Q05306 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Col10a1Q05306 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col10a1Q05306 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col10a1Q05306 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Col10a1Q05306 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col10a1Q05306 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Col10a1Q05306 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col10a1Q05306 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col10a1Q05306 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col10a1Q05306 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col10a1Q05306 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col10a1Q05306 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col10a1Q05306 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col10a1Q05306 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col10a1Q05306 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col10a1Q05306 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col10a1Q05306 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Col10a1Q05306 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col10a1Q05306 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col10a1Q05306 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col10a1Q05306 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col10a1Q05306 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Col10a1Q05306 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col10a1Q05306 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col10a1Q05306 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col10a1Q05306 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Col10a1Q05306 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Col10a1Q05306 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Col10a1Q05306 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col10a1Q05306 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col10a1Q05306 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col10a1Q05306 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col10a1Q05306 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Col10a1Q05306 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col10a1Q05306 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col10a1Q05306 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col10a1Q05306 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col10a1Q05306 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col10a1Q05306 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col10a1Q05306 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col10a1Q05306 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col10a1Q05306 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col10a1Q05306 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col10a1Q05306 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col10a1Q05306 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Col10a1Q05306 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col10a1Q05306 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col10a1Q05306 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col10a1Q05306 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms