RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 PMP22Q01453 160 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ASAH1Q13510 395 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ACER2Q5QJU3 275 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 FAM122BQ7Z309 247 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR5AS1Q8N127 324 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SYS1Q8N2H4 156 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CT55Q8WUE5 264 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 YIPF5Q969M3 257 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZNF649Q9BS31 505 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PBOV1Q9GZY1 135 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ARL6Q9H0F7 186 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TRIM64BA6NI03 449 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 NXPH3O95157 252 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SFTPBP07988 381 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 RAB3AP20336 220 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 UQCRC1P31930 480 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 DDOSTP39656 456 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 NPY4RP50391 375 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PER3P56645 1201 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 RAB15P59190 212 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZXDAP98168 799 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 FAPQ12884 760 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TNK1Q13470 666 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 FHL1Q13642 323 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 IGFBP7Q16270 282 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 P4HA3Q7Z4N8 544 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CHST6Q9GZX3 395 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TCFL5Q9UL49 500 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TNFSF12O43508 249 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 UPK3AO75631 287 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 RPA2P15927 270 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 S100A10P60903 97 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TAF9Q16594 264 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ST3GAL2Q16842 350 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 Q5BKY6 102 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 HES3Q5TGS1 186 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 C5orf63A6NC05 138 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 A6NIZ1 184 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 LIPT2A6NK58 231 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 M0R296 226 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TNFRSF10AO00220 468 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SLC22A5O76082 557 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 RGS11O94810 467 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 HLA-HP01893 362 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 LCN1P31025 176 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZNF84P51523 738 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MTCP1P56278 107 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 RAP1BP61224 184 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 RAP1AP62834 184 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TSC22D1Q15714 1073 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ZNF774Q6NX45 483 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TMPPEQ6ZT21 453 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 NICN1Q9BSH3 213 aa6.68□□□□□ -1.34
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