RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SNTG1Q9NSN8 517 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 PROCRQ9UNN8 238 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TTLL8A6PVC2 850 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL6IP5O75915 188 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 CLPXO76031 633 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TTRP02766 147 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC2LP0C7M8 214 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 OCM2P0CE71 109 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 GLI4P10075 376 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 OR51A4Q8NGJ6 313 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 SPTSSAQ969W0 71 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A46Q96AG3 418 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 DERL3Q96Q80 235 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PPK0 400 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ACOD1A6NK06 481 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 F5H5K5 113 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ERVH48-1M5A8F1 160 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 CASKO14936 926 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 PIN1P1O15428 100 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 APOC1P02654 83 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 SOX6P35712 828 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 RBPJQ06330 500 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM244Q5VVB8 128 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC7A6Q92536 515 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 BARHL1Q9BZE3 327 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TPK1Q9H3S4 243 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF121Q9H920 327 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 NOX4Q9NPH5 578 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC17A5Q9NRA2 495 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 HLA-HP01893 362 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 DBHP09172 617 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 COX5AP20674 150 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ACHEP22303 614 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 RORCP51449 518 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TGFBR3Q03167 851 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 LY6DQ14210 128 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 DPPA2Q7Z7J5 298 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 GABRG1Q8N1C3 465 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ATPIF1Q9UII2 106 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 M0R135 149 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ACSM4P0C7M7 580 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC2A1P11166 492 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 MYL9P24844 172 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ARR3P36575 388 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 SOX2P48431 317 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TBRG1Q3YBR2 411 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF404Q494X3 552 aa21.72■■□□□ 1.07
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CAPNS1-215ENST00000628018 HSD17B12Q53GQ0 312 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 PCSK4Q6UW60 755 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 NAA40Q86UY6 237 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TPRA1Q86W33 373 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF610Q8N9Z0 462 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8B12Q8NGG6 310 aa21.72■■□□□ 1.07
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CAPNS1-215ENST00000628018 THRSPQ92748 146 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF799Q96GE5 643 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 BOD1Q96IK1 185 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC24A3Q9HC58 644 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF319Q9P2F9 582 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TINAGQ9UJW2 476 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 HHLA2Q9UM44 414 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 A3GALT2U3KPV4 340 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 P2RY10O00398 339 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 UBL3O95164 117 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 RAF1P04049 648 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ANOS1P23352 680 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 HTR5AP47898 357 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 DRAM2Q6UX65 266 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM57BQ71RH2 274 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 MCFD2Q8NI22 146 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 SFXN3Q9BWM7 321 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 NOX3Q9HBY0 568 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BSH0 61 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 CD79AP11912 226 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TPTEP56180 551 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB1AP62820 205 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 GABRA6Q16445 453 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM53Q6P2H8 277 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 ASB5Q8WWX0 329 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM106AQ96A25 262 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP27Q9H306 513 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 B3GNT2Q9NY97 397 aa21.7■■□□□ 1.07
CAPNS1-215ENST00000628018 LYZL6O75951 148 aa21.7■■□□□ 1.06
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