RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 ASPHD2Q6ICH7 369 aa19.74■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 SYNPRQ8TBG9 265 aa19.74■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 ENKURQ8TC29 256 aa19.74■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 SLC25A38Q96DW6 304 aa19.74■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 DLL3Q9NYJ7 618 aa19.74■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 MUC6Q6W4X9 2439 aa19.73■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 LYRM1O43325 122 aa19.73■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 NRN1LQ496H8 165 aa19.73■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 CHMP1BQ7LBR1 199 aa19.73■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 OR5D14Q8NGL3 314 aa19.73■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 TRIM63Q969Q1 353 aa19.73■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 NEURL2Q9BR09 285 aa19.73■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 LINC00470Q9BZP3 86 aa19.73■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 SLC17A5Q9NRA2 495 aa19.73■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 A0A1B0GVC2 190 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 A6NIN4 97 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 ZNF724A8MTY0 619 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 NTF4P34130 210 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 SCRN3Q0VDG4 424 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 ECH1Q13011 328 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 CAMK2BQ13554 666 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 FAM166AQ6J272 317 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 LRRC18Q8N456 261 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 CCDC54Q8NEL0 328 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 OR6M1Q8NGM8 313 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 SPTSSAQ969W0 71 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 PRRG4Q9BZD6 226 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 CCL1P22362 96 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 PCBD1P61457 104 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 CLN3Q13286 438 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 FDCSPQ8NFU4 85 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 OR8B12Q8NGG6 310 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 FOXB1Q99853 325 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 LDAHQ9H6V9 325 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 SLC5A6Q9Y289 635 aa19.72■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 A0A1B0GTI1 187 aa19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 SSX4O60224 188 aa19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 ITGA5P08648 1049 aa19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 DDOSTP39656 456 aa19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 DOK3Q7L591 496 aa19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 DTX3Q8N9I9 347 aa19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 DUSP18Q8NEJ0 188 aa19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 OR51E1Q8TCB6 317 aa19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 SMIM4Q8WVI0 70 aa19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 FAM3DQ96BQ1 224 aa19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 FGGYQ96C11 551 aa19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 ZFP3Q96NJ6 502 aa19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 BCO1Q9HAY6 547 aa19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 PLEK2Q9NYT0 353 aa19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
USP36-218ENST00000590546 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 KRT33AO76009 404 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 CPN1P15169 458 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 HTR2CP28335 458 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 GALK2Q01415 458 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 RAB35Q15286 201 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 TMEM69Q5SWH9 247 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 PLPP7Q8NBV4 271 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 NEDD4LQ96PU5 975 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 EXO5Q9H790 373 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 GPR35Q9HC97 309 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 NPAP1Q9NZP6 1156 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 A0A0U1RQV5 110 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 CENPXA8MT69 81 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 WT1P19544 449 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 BDKRB2P30411 391 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 CEACAM16Q2WEN9 425 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 C1orf100Q5SVJ3 147 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 PLET1Q6UQ28 207 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 FAM57BQ71RH2 274 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 PGAP1Q75T13 922 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 PRSS45Q7RTY3 260 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 CHAC2Q8WUX2 184 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 YIPF5Q969M3 257 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 FBXO17Q96EF6 278 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 PGAM5Q96HS1 289 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 TMEM138Q9NPI0 162 aa19.7■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 TRAV17A0A0B4J275 112 aa19.69■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 GABARAPH6UMI1 98 aa19.69■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 SGCEO43556 437 aa19.69■□□□□ 0.74
USP36-218ENST00000590546 DOK2O60496 412 aa19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms