RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478538.1

ITGB3BP-211, Transcript of integrin subunit beta 3 binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB3BP, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BP-211ENST00000478538 UGT1A8Q9HAW9 530 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 DOCK5Q9H7D0 1870 aa2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 BPTFQ12830 3046 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 A0A0D9SFI3 127 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 ERICH2A1L162 156 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 GJE1A6NN92 205 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 KLLNB2CW77 178 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 SIRPB1O00241 398 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 CDC7O00311 574 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 PPP1R2P9O14990 202 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 DNAJB6O75190 326 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 DCNP07585 359 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 ANXA5P08758 320 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 CSF3P09919 207 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 IGKV1-13P0DP09 117 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 FOXN2P32314 431 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 AQP2P41181 271 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 WNT4P56705 351 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 TRDNQ13061 729 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC16A14Q7RTX9 510 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 PEX26Q7Z412 305 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 IQCKQ8N0W5 287 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 METTL13Q8N6R0 699 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR4A4PQ8NGN8 299 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 AGR3Q8TD06 166 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 MYDGFQ969H8 173 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 SGK3Q96BR1 496 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 MED8Q96G25 268 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC29A1Q99808 456 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 PSTPIP2Q9H939 334 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMEM165Q9HC07 324 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 RAB23Q9ULC3 237 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 ING4Q9UNL4 249 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 FANCMQ8IYD8 2048 aa2.76□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 COL1A2P08123 1366 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 ITPR1Q14643 2758 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 IGF2RP11717 2491 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 F5P12259 2224 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 A0A0B4J2A0 478 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 A0A1B0GVI7 797 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 LRRIQ4A6NIV6 560 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 CASC3O15234 703 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF861PO60384 105 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 TNFSF13O75888 250 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 INSP01308 110 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 IGHV3-43DP0DP04 118 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 CRISP2P16562 243 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 DCKP27707 260 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC1A1P43005 524 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 RORCP51449 518 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 CCR8P51685 355 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 LIPEQ05469 1076 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 SELENBP1Q13228 472 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 IL18Q14116 193 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 FZD2Q14332 565 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 SGCAQ16586 387 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 CLLU1OSQ5K130 101 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 C22orf42Q6IC83 251 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 LCN12Q6JVE5 192 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 LUZP2Q86TE4 346 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 LIX1Q8N485 282 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 COMMD1Q8N668 190 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 DCAF4L2Q8NA75 395 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 LINC01555Q8NAE3 123 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 BBOF1Q8ND07 529 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR4F15Q8NGB8 312 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR10R2Q8NGX6 335 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR2G3Q8NGZ4 309 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 CXorf40AQ8TE69 158 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 LRRC58Q96CX6 371 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 OR2M2Q96R28 347 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 LZTS2Q9BRK4 669 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 OSBPL10Q9BXB5 764 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 SHPKQ9UHJ6 478 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF225Q9UK10 706 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa2.75□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 SDK1Q7Z5N4 2213 aa2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
ITGB3BP-211ENST00000478538 FREM2Q5SZK8 3169 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms