RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 GRB2P62993 217 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP3R1P63098 170 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ECH1Q13011 328 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.981e-9■■■■□ 25
RABGGTB-201ENST00000319942 STK11Q15831 433 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR38Q5JTN6 314 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 PHYHD1Q5SRE7 291 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 IDNKQ5T6J7 187 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 LUZP2Q86TE4 346 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF100Q8IYN0 542 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS35Q8N3Z0 413 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 OR13C5Q8NGS8 318 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 FNDC9Q8TBE3 224 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 HSD17B8Q92506 261 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 WACQ9BTA9 647 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF416Q9BWM5 594 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 GLRX2Q9NS18 164 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 COMMD3Q9UBI1 195 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 HHLA2Q9UM44 414 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 CAMK2AQ9UQM7 478 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 CSAG2Q9Y5P2 127 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPRBP23467 1997 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC22A20A6NK97 555 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 J3QRK9 145 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 AQP7O14520 342 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 RER1O15258 196 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 CRYABP02511 175 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ISG15P05161 165 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 CST2P09228 141 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 NTF4P34130 210 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ETV6P41212 452 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 KIR3DL2P43630 455 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 CAV3P56539 151 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ODF4Q2M2E3 257 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 NRN1LQ496H8 165 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM27D1Q5T7N8 215 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 BCL2L15Q5TBC7 163 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZS92 163 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC190Q86UF4 302 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 TUSC5Q8IXB3 177 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 RDH10Q8IZV5 341 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC18Q8N456 261 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 MFSD4AQ8N468 514 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 IL17RDQ8NFM7 739 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 DERL3Q96Q80 235 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ATF6BQ99941 703 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 MRI1Q9BV20 369 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 MOB1AQ9H8S9 216 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 CALHM2Q9HA72 323 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR35Q9HC97 309 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCB9Q9NP78 766 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 UPB1Q9UBR1 384 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 CKLFQ9UBR5 152 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 DKK4Q9UBT3 224 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 WASF3Q9UPY6 502 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 DHDHQ9UQ10 334 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC22A13Q9Y226 551 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-201ENST00000319942 SHISA3A0PJX4 238 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FABP12A6NFH5 140 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 DVL2O14641 736 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC19A2O60779 497 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 NCR1O76036 304 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF12P17014 697 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ACHEP22303 614 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CTSSP25774 331 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SOX2P48431 317 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PMP22Q01453 160 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SCRN3Q0VDG4 424 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ELFN2Q5R3F8 820 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SFXN4Q6P4A7 337 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF283Q8N7M2 679 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SPTSSAQ969W0 71 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM106AQ96A25 262 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 APH1AQ96BI3 265 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 WDFY2Q96P53 400 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNJ15Q99712 375 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXB1Q99853 325 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms