RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614059.4

RPS6KC1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR1J2Q8NGS2 313 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR4C3Q8NH37 302 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR51H1Q8NH63 302 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC46A1Q96NT5 459 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 STACQ99469 402 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRSS44E7EML9 344 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 CD1CP29017 333 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 TSFMP43897 325 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 CDK5Q00535 292 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 HDAC8Q9BY41 377 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 KIF25Q9UIL4 384 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 GAB2Q9UQC2 676 aa12.7□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 LRRC37AA6NMS7 1700 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF831Q5JPB2 1677 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM200CA6NKL6 621 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 FFAR1O14842 300 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 IL2RGP31785 369 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 MMP15P51511 669 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 HMGA2P52926 109 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 ADIRFQ15847 76 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF74Q16587 644 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR51A4Q8NGJ6 313 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 MIXL1Q9H2W2 232 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 DLL4Q9NR61 685 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF724A8MTY0 619 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 TRAPPC2LH3BP13 241 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 GPANK1O95872 356 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACTBL2Q562R1 376 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 HIST2H3AQ71DI3 136 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM123Q8N131 208 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR2G3Q8NGZ4 309 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 TSLPQ969D9 159 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARL5BQ96KC2 179 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 UQCC2Q9BRT2 126 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 PHIPQ8WWQ0 1821 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 GPR137BO60478 399 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 FCGR2CP31995 323 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 ARL3P36405 182 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 GPR85P60893 370 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 BDH1Q02338 343 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 C17orf67Q0P5P2 114 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 PGAP1Q75T13 922 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 C10orf90Q96M02 699 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 CDH20Q9HBT6 801 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC39A9Q9NUM3 307 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 CTSFQ9UBX1 484 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 SIGLEC7Q9Y286 467 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC5A6Q9Y289 635 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 CCL27Q9Y4X3 112 aa12.69□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 CD160O95971 181 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 CHRM2P08172 466 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 DCAF7P61962 342 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 RPS15P62841 145 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF77Q15935 545 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF79Q15937 498 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 ABHD17BQ5VST6 288 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 FCRL6Q6DN72 434 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 BCORP1Q8N888 145 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 BLACEA4D250 179 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACTL6BO94805 426 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 HPXP02790 462 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 AGBL4Q5VU57 503 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 NAA40Q86UY6 237 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 NKAIN3Q8N8D7 197 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR9K2Q8NGE7 335 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR4D11Q8NGI4 311 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR51B4Q9Y5P0 310 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 V9GYH0 126 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 SNRPGP15A8MWD9 76 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 CLDN1O95832 211 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 FOLR1P15328 257 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 DPTQ07507 201 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 MLC1Q15049 377 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 LPCAT3Q6P1A2 487 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 AAED1Q7RTV5 226 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC38A6Q8IZM9 456 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 STT3BQ8TCJ2 826 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 LURAP1Q96LR2 239 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 FKRPQ9H9S5 495 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 CD207Q9UJ71 328 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 SRPK3Q9UPE1 567 aa12.68□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 UMAD1C9J7I0 102 aa12.67□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF217O75362 1048 aa12.67□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 NME1P15531 152 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 GDF1P27539 372 aa12.67□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 ADPRHP54922 357 aa12.67□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 HTD2P86397 168 aa12.67□□□□□ -0.38
RPS6KC1-208ENST00000614059 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms