RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448974.1

RPS17P13-201, Transcript of ribosomal protein S17 pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene RPS17P13, Length 407 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS17P13-201ENST00000448974 TMEM80Q96HE8 168 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 Q96MT0 163 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 OPALINQ96PE5 141 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 OR5M11Q96RB7 305 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 RASL10BQ96S79 203 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 SH3GL3Q99963 347 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 BCL7BQ9BQE9 202 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 ZNF649Q9BS31 505 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 ZPBPQ9BS86 351 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 CDCA4Q9BXL8 241 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 FN3KQ9H479 309 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 MED20Q9H944 212 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 MMP25Q9NPA2 562 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 CMC2Q9NRP2 79 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 OR14J1Q9UGF5 321 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 CHRNA9Q9UGM1 479 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 CLEC2DQ9UHP7 191 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 OSGIN1Q9UJX0 560 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 BAIAP2Q9UQB8 552 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 CUL9Q8IWT3 2517 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 FRYQ5TBA9 3013 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 DNAJC13O75165 2243 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 ZNF407Q9C0G0 2248 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 DOCK7Q96N67 2140 aa3.55□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 KNTC1P50748 2209 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 CACNA1CQ13936 2221 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 FREM1Q5H8C1 2179 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 ALPK2Q86TB3 2170 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 IRGMA1A4Y4 181 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 FAM183AA6NL82 134 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 A8MXE2 369 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 FTCDNL1E5RQL4 147 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 IMPA2O14732 288 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 NOL3O60936 208 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 NPIPB7O75200 414 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 TRMUO75648 421 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 OR2J2O76002 312 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 NDUFB2O95178 105 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 TPOP07202 933 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 LIMS3P0CW19 117 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 LIMS4P0CW20 117 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 CLUP10909 449 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 GP1BBP13224 206 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 PRF1P14222 555 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 CD36P16671 472 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 ZNF3P17036 446 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 PGCP20142 388 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 CCNA2P20248 432 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 F8A1P23610 371 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 CPT2P23786 658 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 GADD45AP24522 165 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 OTX2P32243 289 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 TGFBR1P36897 503 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 TMED10P49755 219 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 ETV1P50549 477 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 LIMK1P53667 647 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 NCS1P62166 190 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 Q0VFX4 171 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 RAB40BQ12829 278 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 GGTLC2Q14390 218 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 SPCS2Q15005 226 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 SSX1Q16384 188 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 EXT1Q16394 746 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 PLPPR5Q32ZL2 321 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 KRBOX4Q5JUW0 171 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 STPG1Q5TH74 334 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 PLBD1Q6P4A8 553 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 C19orf48Q6RUI8 117 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 NDUFAF7Q7L592 441 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 FAM122BQ7Z309 247 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 NUP54Q7Z3B4 507 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 GRINAQ7Z429 371 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 OAFQ86UD1 273 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 CCDC190Q86UF4 302 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 P2RY8Q86VZ1 359 aa3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RPS17P13-201ENST00000448974 GID4Q8IVV7 300 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms