RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PRELID1Q9Y255 219 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SMIM18P0DKX4 95 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 FOLR1P15328 257 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 HCCSP53701 268 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SPEM2Q0P670 501 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC17A1Q14916 467 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 USP51Q70EK9 711 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 EDARQ9UNE0 448 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 C5orf49A4QMS7 147 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SULT1C2O00338 296 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TNFSF11O14788 317 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 AGERQ15109 404 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PCK2Q16822 640 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF573Q86YE8 665 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PMP2P02689 132 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 RFC3P40938 356 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF385DQ9H6B1 395 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 NDRG3Q9UGV2 375 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CACNA1CQ13936 2221 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 FITM1A5D6W6 292 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 GLAP06280 429 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 BBS1Q8NFJ9 593 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 POC1BQ8TC44 478 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SEC22AQ96IW7 307 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CHST2Q9Y4C5 530 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PRKACAP17612 351 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ALDH3B1P43353 468 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SEH1LQ96EE3 360 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 B9D1Q9UPM9 204 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A096LPE4 126 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PPZ6 126 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 AIPO00170 330 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 GPX5O75715 221 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2A2Q6IF42 318 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 DPPA2Q7Z7J5 298 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 NRASP01111 189 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SSTR2P30874 369 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXC1Q12948 553 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR1C1Q15619 314 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD34AQ69YU3 496 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PAQR8Q8TEZ7 354 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 MALSU1Q96EH3 234 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 MED18Q9BUE0 208 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 EFSO43281 561 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TNFSF12O43508 249 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO24O75426 580 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CLDN1O95832 211 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 CASP3P42574 277 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TPBGQ13641 420 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 BEX5Q5H9J7 111 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SLAMF9Q96A28 289 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PLAC1Q9HBJ0 212 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 KLK10O43240 276 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SERPINA7P05543 415 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP3CBP16298 524 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFB7P17568 137 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF74Q16587 644 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 RAD52P43351 418 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 WNT3P56703 355 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB11AP62491 216 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf87Q8N0U7 546 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms