RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 SIAEQ9HAT2 523 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 HAO2Q9NYQ3 351 aa20.6■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 FREM1Q5H8C1 2179 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PPL8 197 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 CIB4A0PJX0 185 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 OR8G3PP0DMU2 310 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 GAAP10253 952 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 MSR1P21757 451 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 IL32P24001 234 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 PYCR1P32322 319 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 RPS7P62081 194 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 LSM6P62312 80 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 POU4F2Q12837 409 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 LINC01590Q5TEZ4 76 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 STAC2Q6ZMT1 411 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF813Q6ZN06 617 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 P2RY8Q86VZ1 359 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 UBE2FQ969M7 185 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 PIK3IP1Q96FE7 263 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 SEC61A2Q9H9S3 476 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 OBP2BQ9NPH6 170 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 POLE4Q9NR33 117 aa20.59■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 GYPBP06028 91 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 CLUP10909 449 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 GGTLC2Q14390 218 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 ETFDHQ16134 617 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 GABRA6Q16445 453 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 CHRFAM7AQ494W8 412 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM27BQ5VT28 67 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 BBS1Q8NFJ9 593 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC26A10Q8NG04 563 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 OR6K6Q8NGW6 343 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 APH1BQ8WW43 257 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 IGFBPL1Q8WX77 278 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 TEAD3Q99594 435 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 MARCH7Q9H992 704 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa20.58■□□□□ 0.89
CAPNS1-214ENST00000592483 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC182A6NF36 153 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 C16orf97H3BN30 126 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ENTPD6O75354 484 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 LYZL6O75951 148 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 HLA-DQA2P01906 255 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP3CBP16298 524 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 GSTT1P30711 240 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CSNK2BP67870 215 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT80Q6KB66 452 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC22A24Q8N4F4 322 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 OR10H5Q8NGA6 315 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 NABP1Q96AH0 204 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNN2Q9H2S1 579 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 YAE1D1Q9NRH1 226 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC42Q9Y546 428 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.883e-6■□□□□ 9.9
CAPNS1-214ENST00000592483 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 WBP4O75554 376 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CST2P09228 141 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 B4GALT1P15291 398 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF823P16415 610 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CXCR4P61073 352 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CDK5R2Q13319 367 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 SGCAQ16586 387 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 TEX30Q5JUR7 227 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 C9orf135Q5VTT2 229 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 SYT9Q86SS6 491 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 OR51L1Q8NGJ5 315 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 AMDHD2Q9Y303 409 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 IRGMA1A4Y4 181 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 OR5H1A6NKK0 313 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 C12orf71A8MTZ7 269 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF223E7ERA6 249 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CD5LO43866 347 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 TMCC2O75069 709 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 RAD51DO75771 328 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CRYGSP22914 178 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CDAP32320 146 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 UGT2B10P36537 528 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 MTNR1AP48039 350 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 PCBD1P61457 104 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 MED21Q13503 144 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 TBRG1Q3YBR2 411 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 TIMM23BQ5SRD1 257 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHL24Q6TFL4 600 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNRF4Q8WWF5 429 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 C11orf40Q8WZ69 217 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CNBD2Q96M20 576 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 INTS14Q96SY0 518 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-214ENST00000592483 MNTQ99583 582 aa20.55■□□□□ 0.88
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