RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557679.5

ZNF410-223, Transcript of zinc finger protein 410, human

TSL 5

Gene ZNF410, Length 846 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF410-223	ENST00000557679	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679		U3KQV3	271 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	SPG11	Q96JI7	2443 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		5.69	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	PDZD2	O15018	2839 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	PLSCR5	A0PG75	271 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679		H3BN98	237 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679		H3BSA7	217 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	GSC2	O15499	205 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	SGCE	O43556	437 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	DOK2	O60496	412 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	GAST	P01350	101 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	ANXA8	P13928	327 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	CTLA4	P16410	223 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	ZNF823	P16415	610 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	LIPA	P38571	399 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	BLVRA	P53004	296 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	UCP2	P55851	309 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	RIPPLY3	P57055	190 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	CBX1	P83916	185 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	PSG4	Q00888	419 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	TNK1	Q13470	666 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	SVOPL	Q8N434	492 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	GJC3	Q8NFK1	279 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	OR2T33	Q8NG76	320 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	OR2T4	Q8NH00	348 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	OR4K13	Q8NH42	304 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	NABP1	Q96AH0	204 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	NMNAT3	Q96T66	252 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	REG4	Q9BYZ8	158 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	NUAK2	Q9H093	628 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	DLL4	Q9NR61	685 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	IL20	Q9NYY1	176 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	DUSP13	Q9UII6	198 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	POMP	Q9Y244	141 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	AKAP6	Q13023	2319 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	OR6C6	A6NF89	314 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	TRIM64B	A6NI03	449 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	FKBP6	O75344	327 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	ABHD16A	O95870	558 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	HEXA	P06865	529 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	ADRA2A	P08913	450 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	FCGR1A	P12314	374 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	CCL2	P13500	99 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	ZNF3	P17036	446 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	EPHA1	P21709	976 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ZNF410-223	ENST00000557679	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.7 ms