RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516819.2

RNU6-453P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 453, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-453P, Length 85 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-453P-201ENST00000516819 HSMCR30P0CW71 290 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 RAB3AP20336 220 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 GZMHP20718 246 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 NT5EP21589 574 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 MMP11P24347 488 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 LOXP28300 417 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 CDKN1BP46527 198 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 FOXF1Q12946 379 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 BTN1A1Q13410 526 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 CHRNA6Q15825 494 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 GGTA1PQ4G0N0 100 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 RAB12Q6IQ22 244 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 CATSPER4Q7RTX7 472 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 ECHDC2Q86YB7 292 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 STK40Q8N2I9 435 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 FAM133AQ8N9E0 248 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 OR52B4Q8NGK2 314 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 SLC2A14Q8TDB8 520 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 TMEM54Q969K7 222 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 PIK3IP1Q96FE7 263 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 GALNT14Q96FL9 552 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 HSFY1Q96LI6 401 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 TTC25Q96NG3 672 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 TXNDC17Q9BRA2 123 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 DSN1Q9H410 356 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 LINC00574Q9H8X3 128 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 TIMM44O43615 452 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 OR1F1O43749 312 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 MBD3O95983 291 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 IGHV2-5P01817 119 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 SLC35G6P0C7Q6 338 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 F2RP25116 425 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 G6PCP35575 357 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 FDFT1P37268 417 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 MAGEA6P43360 314 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 HCAR3P49019 387 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 TMED10P49755 219 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 EMP2P54851 167 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 CDKN2DP55273 166 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 GAMTQ14353 236 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 DMRTC1Q5HYR2 192 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 DEGS2Q6QHC5 323 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 SNX31Q8N9S9 440 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 OR11H7Q8NGC8 314 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 OR10J6PQ8NGY7 276 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 OR4K13Q8NH42 304 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 MS4A4EQ96PG1 132 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 OR8B4Q96RC9 309 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 MARVELD1Q9BSK0 173 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 TCHPQ9BT92 498 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 GGTLC1Q9BX51 225 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 MFFQ9GZY8 342 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 SMOXQ9NWM0 555 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 RPH3ALQ9UNE2 315 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 NCAPD2Q15021 1401 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 SIGLEC16A6NMB1 481 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 DYNC1I1O14576 645 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 SEMA3DO95025 777 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 AIFM1O95831 613 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 CD3GP09693 182 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 THRAP10827 490 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 CEACAM3P40198 252 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 QARSP47897 775 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 P2RX1P51575 399 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 CCL23P55773 120 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 CBX3Q13185 183 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 CUL2Q13617 745 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 GANABQ14697 944 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 CEBPEQ15744 281 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 TATDN3Q17R31 274 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 KLHL38Q2WGJ6 581 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 ERO1BQ86YB8 467 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 KDM8Q8N371 416 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 OR1F12Q8NHA8 337 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 CACNG8Q8WXS5 425 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 FAM3CQ92520 227 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 KRT35Q92764 455 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 OTUB2Q96DC9 234 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 HIGD2AQ9BW72 106 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 DLG5Q8TDM6 1919 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 A0A1B0GUH1 482 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 CLDN3O15551 220 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 SCO1O75880 301 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 RPN2P04844 631 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 C2P06681 752 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-453P-201ENST00000516819 HTR2AP28223 471 aa-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms